{"id":2269,"date":"2023-08-24T08:18:41","date_gmt":"2023-08-24T08:18:41","guid":{"rendered":"https:\/\/weseq.it\/?post_type=ht_kb&#038;p=2269"},"modified":"2024-11-06T11:02:52","modified_gmt":"2024-11-06T10:02:52","slug":"analiza-bioinformatyczna","status":"publish","type":"ht_kb","link":"https:\/\/weseq.it\/en\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/","title":{"rendered":"Analiza bioinformatyczna"},"content":{"rendered":"<p>Wychodz\u0105c naprzeciw Pa\u0144stwa potrzebom oferujemy r\u00f3wnie\u017c analiz\u0119 bioinformatyczn\u0105 uzyskanych wynik\u00f3w dopasowan\u0105 do przeprowadzonego sekwencjonowania, materia\u0142u wyj\u015bciowego oraz stawianych hipotez badawczych.<\/p>\n\n\n\n<p><strong>Czym jest analiza bioinformatyczna?<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Analiza bioinformatyczna to pot\u0119\u017cne narz\u0119dzie, kt\u00f3re pozwala na interpretacj\u0119 danych z sekwencjonowania. Samo sekwencjonowanie generuje ogromne ilo\u015bci danych, w postaci odczyt\u00f3w w parach zasad &#8211; sekwencji. Odpowiednie zastosowanie r\u00f3\u017cnego rodzaju narz\u0119dzi bioinformatycznych pozwala na odkrycie cennych informacji ukrytych w surowych danych sekwencjonowania, m.in. takich jak:<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li><strong>Identyfikacja gen\u00f3w i ich wariant\u00f3w:<\/strong> analiza bioinformatyczna pozwala na identyfikacj\u0119 np. aktywnych gen\u00f3w w badanym materiale\/pr\u00f3bce, a tak\u017ce wykry\u0107 warianty genetyczne, takie jak mutacje, polimorfizmy i zmiany liczby kopii.<\/li>\n\n\n\n<li><strong>Ekspresja gen\u00f3w:<\/strong> przeprowadzaj\u0105c analiz\u0119 transkryptomu: RNAseq i wykorzystuj\u0105c narz\u0119dzia bioinformatyczne mo\u017cemy okre\u015bli\u0107 poziom ekspresji gen\u00f3w w r\u00f3\u017cnych warunkach, por\u00f3wna\u0107 ekspresj\u0119 gen\u00f3w pomi\u0119dzy pr\u00f3bkami, a tak\u017ce przeanalizowa\u0107 jak zmienia si\u0119 ekspresja w trwania badanego procesu. Wszystko zale\u017cy od zastosowanego podej\u015bcia do sekwencjonowania a nast\u0119pnie do analizy bioinformatycznej, dlatego bardzo istotne jest jeszcze przez zleceniem us\u0142ugi okre\u015blenie konkretnych potrzeb \/ hipotez \/pyta\u0144 aby dobrze zaplanowa\u0107 eksperyment.<\/li>\n\n\n\n<li><strong>Struktura i funkcja genomu:<\/strong> Analiza bioinformatyczna mo\u017ce pom\u00f3c w poznaniu struktury i funkcji genomu, w tym identyfikacji element\u00f3w regulacyjnych i region\u00f3w koduj\u0105cych bia\u0142ka. Bioinformatyczna analiza genomu mo\u017cliwa jest po sekwencjonowaniu ca\u0142ogenomowym tzn. Whole Genome Sequencing &#8211; WGS, kt\u00f3ra pozwala r\u00f3wnie\u017c na sk\u0142adanie\/monta\u017c (z ang. assembly) genom\u00f3w de novo dla organizm\u00f3w kt\u00f3re nie posiadaj\u0105 zsekwencjonowanego genomu referencyjnego.<\/li>\n\n\n\n<li><strong>Identyfikacja mikroorganizm\u00f3w<\/strong> &#8211;  wykorzystanie sekwencjonowania Amplicon Seq 16Sr\/ITS wraz z analiz\u0105 bioinformatyczn\u0105 pozwala na identyfikacj\u0119 konkretnych grup mikroorganizm\u00f3w bakterii i grzyb\u00f3w w badanym materiale. Takie podej\u015bcie do analizy sk\u0142adu mikrobiomu, znalaz\u0142o szerokie zastosowanie w medycynie, rolnictwie i ochronie \u015brodowiska. <\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p><strong>Ka\u017cda nasza us\u0142uga sekwencjonowania w weSEQ.IT zawiera podstawow\u0105 analiz\u0119 bioinformatyczn\u0105, kt\u00f3ra obejmuje analiz\u0119 jako\u015bci danych po sekwencjonowaniu.<br><br>Na \u017cyczenie klienta w cenie us\u0142ugi sekwencjonowania mo\u017cemy r\u00f3wnie\u017c przeprowadzi\u0107:<\/strong><\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>Trimming sekwencji adaptor\u00f3w &#8211; usuni\u0119cie z odczyt\u00f3w surowych sekwencji adaptor\u00f3w wykorzystanych do sekwencjonowania;<\/li>\n\n\n\n<li>Dostarczenie wynik\u00f3w w postaci oczyszczonych danych (tzw. clean reads)<br><\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p><strong>Zaawansowana<\/strong> <strong>analiza bioinformatyczna (dodatkowo p\u0142atna):<\/strong> r\u00f3\u017cni si\u0119 w zale\u017cno\u015bci od wybranego rodzaju sekwencjonowania i mo\u017ce by\u0107 dostosowywana do potrzeb projektu, a obejmowa\u0107 mo\u017ce m.in.:<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>Badanie struktury i funkcji genomu, monta\u017c genomu (z ang. Genom Assembly, r\u00f3wnie\u017c z opcj\u0105 0-gap) wraz z SNP i InDel calling jako wynik sekwencjonowania <strong>WGS<\/strong><\/li>\n\n\n\n<li>Identyfikacj\u0119 SNP\/InDel i nowych gen\u00f3w oraz r\u00f3\u017cnych ich wariant\u00f3w; r\u00f3\u017cnicow\u0105 analiz\u0119 ekspresji gen\u00f3w (DEGs) oraz analiz\u0119 funkcjonaln\u0105 gen\u00f3w o zmienionej ekspresji (GO) jako wynik sekwencjonowania transkryptomu <strong>RNAseq<\/strong>.<\/li>\n\n\n\n<li>Identyfikacj\u0119 nowych ma\u0142ych cz\u0105steczek RNA, analiz\u0119 zmian ekspresji smallRNA oraz adnotacje i funkcjonalne analizy gen\u00f3w docelowych analizowanych sRNA jako wynik sekwencjonowania <strong>small RNAseq<\/strong>.<\/li>\n\n\n\n<li>Analiz\u0119 Operational Taxonomic Unit (OTU), dystrubucj\u0119 gatunkow\u0105 oraz analiz\u0119 Alpha i Beta diveristy wraz z por\u00f3wnaniami pomi\u0119dzy pr\u00f3bkami jako elementy analizy bioinformatycznej sekwencjonowania <strong>Amplicon Seq 16S rRNA<\/strong>.<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p><strong>Dlaczego warto skorzysta\u0107 z naszych us\u0142ug analizy bioinformatycznej?<\/strong><\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>Dostarczymy wyniki analiz bioinformatycznych w postaci gotowych do wykorzystania w publikacji:\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>tabel,&nbsp;<\/li>\n\n\n\n<li>wykres\u00f3w,<\/li>\n\n\n\n<li>heatmap,<\/li>\n\n\n\n<li>schemat\u00f3w,<\/li>\n\n\n\n<li>dok\u0142adnych opis\u00f3w zastosowanych narz\u0119dzi i metod.<\/li>\n<\/ul>\n<\/li>\n\n\n\n<li>Analiz\u0119 przeprowadzi dla Pa\u0144stwa do\u015bwiadczony zesp\u00f3\u0142 bioinformatyk\u00f3w;<\/li>\n\n\n\n<li>Dzi\u0119ki opracowanym i sprawdzonym pipline (procedurom) gwarantujemy szybk\u0105, rzeteln\u0105 i wiarygodn\u0105 analiz\u0119;<\/li>\n\n\n\n<li>Konkurencyjne ceny;<\/li>\n\n\n\n<li>Dajemy mo\u017cliwo\u015b\u0107 dostosowania analizy do indywidualnych potrzeb.<\/li>\n\n\n\n<li>Wyniki przes\u0142ane w postaci tabel oraz plik\u00f3w tekstowych s\u0105 w wersji edytowalnej, tak aby mogli Pa\u0144stwo zawsze do nich wr\u00f3ci\u0107 i wyci\u0105gn\u0105\u0107 interesuj\u0105ce w danym momencie dane.<br><\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<p><strong>Rekomendujemy aby wskaza\u0107 konkretne wymagania stawiane analizie bioinformatycznej podczas uzupe\u0142niania <\/strong><a href=\"https:\/\/weseq.it\/en\/specyfikacja-projektu\/\"><strong>formularza specyfikacji projektu<\/strong><\/a><strong>.<\/strong><\/p>\n\n\n\n<p>Zakres analizy mo\u017cna r\u00f3wnie\u017c przedyskutowa\u0107 \/ uzgodni\u0107 z Naszym Dzia\u0142em wsparcia kt\u00f3ry odpowie na pojawiaj\u0105ce si\u0119 pytania i w\u0105tpliwo\u015bci.<\/p>\n\n\n\n<p>Poni\u017cej przedstawiamy przyk\u0142adowe Raporty Demo z analizy mRNAseq, smallRNAseq oraz WGS.<br><br><strong>Skontaktuj si\u0119 z nami ju\u017c dzi\u015b, aby dowiedzie\u0107 si\u0119 wi\u0119cej o naszych us\u0142ugach analizy bioinformatycznej!<\/strong><\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Wychodz\u0105c naprzeciw Pa\u0144stwa potrzebom oferujemy r\u00f3wnie\u017c analiz\u0119 bioinformatyczn\u0105 uzyskanych wynik\u00f3w dopasowan\u0105 do przeprowadzonego sekwencjonowania, materia\u0142u wyj\u015bciowego oraz stawianych hipotez badawczych. Czym jest analiza bioinformatyczna? Analiza bioinformatyczna to pot\u0119\u017cne narz\u0119dzie, kt\u00f3re pozwala na interpretacj\u0119 danych z sekwencjonowania. Samo sekwencjonowanie generuje ogromne ilo\u015bci danych, w postaci odczyt\u00f3w w parach zasad &#8211; sekwencji&#8230;.<\/p>","protected":false},"author":1,"comment_status":"open","ping_status":"closed","template":"","format":"standard","meta":{"footnotes":""},"ht-kb-category":[41],"ht-kb-tag":[134,68,69],"class_list":["post-2269","ht_kb","type-ht_kb","status-publish","format-standard","hentry","ht_kb_category-uslugi-ngs","ht_kb_tag-analiza-bioinformatyczna","ht_kb_tag-bi","ht_kb_tag-bioinformatics"],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO Premium plugin v24.9 (Yoast SEO v27.4) - https:\/\/yoast.com\/product\/yoast-seo-premium-wordpress\/ -->\n<title>Analiza bioinformatyczna - weSEQ.IT<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/weseq.it\/en\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"en_GB\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Analiza bioinformatyczna\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"Wychodz\u0105c naprzeciw Pa\u0144stwa potrzebom oferujemy r\u00f3wnie\u017c analiz\u0119 bioinformatyczn\u0105 uzyskanych wynik\u00f3w dopasowan\u0105 do przeprowadzonego sekwencjonowania, materia\u0142u wyj\u015bciowego oraz stawianych hipotez badawczych. Czym jest analiza bioinformatyczna? Analiza bioinformatyczna to pot\u0119\u017cne narz\u0119dzie, kt\u00f3re pozwala na interpretacj\u0119 danych z sekwencjonowania. Samo sekwencjonowanie generuje ogromne ilo\u015bci danych, w postaci odczyt\u00f3w w parach zasad &#8211; sekwencji....\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/weseq.it\/en\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"weSEQ.IT\" \/>\n<meta property=\"article:publisher\" content=\"https:\/\/www.facebook.com\/weSEQ.IT\" \/>\n<meta property=\"article:modified_time\" content=\"2024-11-06T10:02:52+00:00\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Estimated reading time\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"4 minutes\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\\\/\\\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/baza_wiedzy\\\/analiza-bioinformatyczna\\\/\",\"url\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/baza_wiedzy\\\/analiza-bioinformatyczna\\\/\",\"name\":\"Analiza bioinformatyczna - weSEQ.IT\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/#website\"},\"datePublished\":\"2023-08-24T08:18:41+00:00\",\"dateModified\":\"2024-11-06T10:02:52+00:00\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/baza_wiedzy\\\/analiza-bioinformatyczna\\\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"en-GB\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/baza_wiedzy\\\/analiza-bioinformatyczna\\\/\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/baza_wiedzy\\\/analiza-bioinformatyczna\\\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Home\",\"item\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"Analiza bioinformatyczna\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/#website\",\"url\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/\",\"name\":\"weSEQ.IT\",\"description\":\"Turn ideas into data files.\",\"publisher\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/#organization\"},\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"en-GB\"},{\"@type\":[\"Organization\",\"Place\"],\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/#organization\",\"name\":\"weSEQ.IT\",\"url\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/\",\"logo\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/baza_wiedzy\\\/analiza-bioinformatyczna\\\/#local-main-organization-logo\"},\"image\":{\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/baza_wiedzy\\\/analiza-bioinformatyczna\\\/#local-main-organization-logo\"},\"sameAs\":[\"https:\\\/\\\/www.facebook.com\\\/weSEQ.IT\"],\"openingHoursSpecification\":[{\"@type\":\"OpeningHoursSpecification\",\"dayOfWeek\":[\"Monday\",\"Tuesday\",\"Wednesday\",\"Thursday\",\"Friday\",\"Saturday\",\"Sunday\"],\"opens\":\"09:00\",\"closes\":\"17:00\"}]},{\"@type\":\"ImageObject\",\"inLanguage\":\"en-GB\",\"@id\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/baza_wiedzy\\\/analiza-bioinformatyczna\\\/#local-main-organization-logo\",\"url\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2022\\\/02\\\/cropped-32915_weSeq.it_RD_GR-01_small-1.png\",\"contentUrl\":\"https:\\\/\\\/weseq.it\\\/wp-content\\\/uploads\\\/2022\\\/02\\\/cropped-32915_weSeq.it_RD_GR-01_small-1.png\",\"width\":200,\"height\":60,\"caption\":\"weSEQ.IT\"}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO Premium plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Analiza bioinformatyczna - weSEQ.IT","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/weseq.it\/en\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/","og_locale":"en_GB","og_type":"article","og_title":"Analiza bioinformatyczna","og_description":"Wychodz\u0105c naprzeciw Pa\u0144stwa potrzebom oferujemy r\u00f3wnie\u017c analiz\u0119 bioinformatyczn\u0105 uzyskanych wynik\u00f3w dopasowan\u0105 do przeprowadzonego sekwencjonowania, materia\u0142u wyj\u015bciowego oraz stawianych hipotez badawczych. Czym jest analiza bioinformatyczna? Analiza bioinformatyczna to pot\u0119\u017cne narz\u0119dzie, kt\u00f3re pozwala na interpretacj\u0119 danych z sekwencjonowania. Samo sekwencjonowanie generuje ogromne ilo\u015bci danych, w postaci odczyt\u00f3w w parach zasad &#8211; sekwencji....","og_url":"https:\/\/weseq.it\/en\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/","og_site_name":"weSEQ.IT","article_publisher":"https:\/\/www.facebook.com\/weSEQ.IT","article_modified_time":"2024-11-06T10:02:52+00:00","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Estimated reading time":"4 minutes"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/weseq.it\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/","url":"https:\/\/weseq.it\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/","name":"Analiza bioinformatyczna - weSEQ.IT","isPartOf":{"@id":"https:\/\/weseq.it\/#website"},"datePublished":"2023-08-24T08:18:41+00:00","dateModified":"2024-11-06T10:02:52+00:00","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/weseq.it\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/#breadcrumb"},"inLanguage":"en-GB","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/weseq.it\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/weseq.it\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Home","item":"https:\/\/weseq.it\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Analiza bioinformatyczna"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/weseq.it\/#website","url":"https:\/\/weseq.it\/","name":"weSEQ.IT","description":"Turn ideas into data files.","publisher":{"@id":"https:\/\/weseq.it\/#organization"},"potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/weseq.it\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"en-GB"},{"@type":["Organization","Place"],"@id":"https:\/\/weseq.it\/#organization","name":"weSEQ.IT","url":"https:\/\/weseq.it\/","logo":{"@id":"https:\/\/weseq.it\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/#local-main-organization-logo"},"image":{"@id":"https:\/\/weseq.it\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/#local-main-organization-logo"},"sameAs":["https:\/\/www.facebook.com\/weSEQ.IT"],"openingHoursSpecification":[{"@type":"OpeningHoursSpecification","dayOfWeek":["Monday","Tuesday","Wednesday","Thursday","Friday","Saturday","Sunday"],"opens":"09:00","closes":"17:00"}]},{"@type":"ImageObject","inLanguage":"en-GB","@id":"https:\/\/weseq.it\/baza_wiedzy\/analiza-bioinformatyczna\/#local-main-organization-logo","url":"https:\/\/weseq.it\/wp-content\/uploads\/2022\/02\/cropped-32915_weSeq.it_RD_GR-01_small-1.png","contentUrl":"https:\/\/weseq.it\/wp-content\/uploads\/2022\/02\/cropped-32915_weSeq.it_RD_GR-01_small-1.png","width":200,"height":60,"caption":"weSEQ.IT"}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/ht-kb\/2269","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/ht-kb"}],"about":[{"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/ht_kb"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=2269"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/ht-kb\/2269\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3119,"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/ht-kb\/2269\/revisions\/3119"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=2269"}],"wp:term":[{"taxonomy":"ht_kb_category","embeddable":true,"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/ht-kb-category?post=2269"},{"taxonomy":"ht_kb_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/weseq.it\/en\/wp-json\/wp\/v2\/ht-kb-tag?post=2269"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}