Przejdź do treści
Baza wiedzy/ Wyniki i pomoc po projekcie/ Format danych - wyniki

Format danych - wyniki

Sprawdź, czym są pliki FASTQ (.gz), jak je pobrać i dlaczego wynik sekwencjonowania przekazujemy w tym formacie.

KATEGORIA
Dostarczenie wyników
ETAP PROJEKTU
05 · Wyniki i pomoc po projekcie
CZAS CZYTANIA
1 min
AKTUALIZACJA
20 listopada 2025
OPRACOWANIE
Zespół Techniczny weSEQ.IT
Wyceń projekt

Dane z sekwencjonowania są przekazywane w formacie zarchiwizowanych plików FASTQ w formacie .gz . Jest to standardowy format plików powszechnie używany w bioinformatyce.

Taka forma umożliwia łatwiejsze pobieranie danych, zmniejsza ich rozmiar oraz ułatwia bezpieczne i efektywne przechowywanie. Po pobraniu pliki te można zdekompresować przy użyciu standardowych narzędzi dostępnych w systemach operacyjnych Linux, macOS oraz Windows.

Pliki wynikowe mogą obejmować m.in. surowe dane w formacie FASTQ, złożone wyniki analiz bioinformatycznych (np. pliki VCF, BAM) oraz raporty QC.

Standardowo dane przekazywane są w postaci odczytów surowych tzw. raw reads, ale na prośbę klienta możemy dostarczyć dane w postaci odczytów oczyszczonych tzw. clean reads.

Celem uzyskania clean reads, surowe odczyty poddawane są obróbce mającej na celu usunięcie odczytów o niskiej jakości oraz trymowaniu tzn. odcięciu z odczytów sekwencji adapterów wykorzystywanych do sekwencjonowania.

Informacje o sekwencjach adaptorów zastosowanych w projekcie znajdują się w Raportach udostępnionych wraz z wynikami.

SŁOWA KLUCZOWE
FASTQfastq.gzformat danychraw readsclean readssurowe odczytyVCFBAMrozpakowanie plików gz
Czy ten artykuł był pomocny?
Twoja odpowiedź pomaga nam poprawiać bazę wiedzy.

Szukasz innego artykułu?

Wróć do wszystkich tematów →

Twoje pytanie nie ma jeszcze artykułu?

Napisz do nas - odpowiemy i dopiszemy je do bazy.