SPECYFIKACJA PROJEKTU

Aby jak najlepiej dopasować ofertę usług NGS do Państwa projektu prosimy o wypełnienie poniższego formularza dotyczącego specyfikacji planowanych analiz. Zalecamy odpowiednie wypełnienie wszystkich pól.
W razie jakichkolwiek pytań lub wątpliwości prosimy o kontakt z Działem Wsparcia Klienta: support@weSEQ.IT

Dzięki uzupełnieniu formularza specyfikacji projektu:

dokładnie zostaną sprecyzowane Państwa potrzeby i wymagania,
unikniemy błędów komunikacji,
zapytanie zostanie od razu przesłane do działu wycen,
zostanie naliczony dodatkowy rabat za samodzielne uzupełnienie zapytania.

Formularz specyfikacji projektu

"*" oznacza pola wymagane

Etap 1 z 4

25%

Hidden

Section 1 – General Information

ID:

Hidden

Data wpłynięcia zapytania:

RRRR ukośnik MM ukośnik DD

Poniższe dane znajdą się na oficjalnej ofercie.

Imię i Nazwisko*

Imię Nazwisko

Email*

Telefon komórkowy*

Hidden

Nazwa firmy / Instytutu-nieaktywne*

Nazwa firmy / Instytutu*

Hidden

NIP*

Wpisz liczbę od 0000000000 do 9999999999.

Hidden

Nazwa projektu – zostanie przedstawiona na oficjalnej ofercie.*

Planowana data wysyłki próbek do analizy:*

RRRR myślnik MM myślnik DD

Cel zapytania:*

Wycena usługi przed zleceniem.Zaznacz tę opcję, jeśli potrzebujesz wyceny przed zleceniem zamówienia. Klienci, którzy mają aktualne i realne potrzeby są traktowani priorytetowo.

Wycena usługi do wniosku o finansowanie projektu.Zaznacz tę opcję, jeśli potrzebujesz wyceny niezbędnej do ogłoszenia przetargu lub złożenia wniosku o finansowanie projektu. Przedstawimy ofertę wstępną wraz z informacjami jakich zmian można się spodziewać.

Oferta potrzebna tylko do spełnienia formalności 3 ofert w zamówieniu publicznym.Zaznacz tę opcję, jeśli nie możesz skorzystać z naszych usług, gdyż firma do zrealizowania zamówienia została już wybrana. Innymi słowy, gdy potrzebujesz jedynie podkładki niezbędnej do spełniania wymogu administracyjnego. Przedstawimy ofertę, która będzie spełniała wymogi trzeciej oferty.

Analiza rynku.Zaznacz tę opcję, jeśli chcesz z ciekawości/poglądowo dowiedzieć się, jaką posiadamy ofertę i poznać ceny, ale nie zamierzasz w najbliższym czasie skorzystać z naszych usług. Przedstawimy w mailu ofertę wstępną.

Kiedy planowane jest ogłoszenie wyników konkursu wniosków o grant na badania?*

RRRR myślnik MM myślnik DD

W jakim celu przeprowadzasz analizę rynku?*

Im więcej wiemy o Twoich potrzebach tym trafniejsze informacje możemy dostarczyć.

Jaki jest cel planowanej analizy?*

Zrozumienie precyzyjnego celu jest kluczowym etapem w procesie tworzenia oferty. Dzięki znajomości celu będziemy w stanie lepiej zinterpretować Twoje potrzeby i zaproponować różnorodne, dostępne opcje, dostosowane do Twoich wymagań.

Zgoda na przetwarzanie danych osobowych*

Wyrażam zgodę na przetwarzanie moich danych osobowych, zawartych w formularzu specyfikacji projektu, dla potrzeb niezbędnych do odpowiedzi na moje zapytanie.

Hidden

Section 2 – Type of service

Typ usługi:*

Pakiety: Genomika, Transkryptomika lub Epigenomika (per próbka)Pakiety zawierają usługę przygotowania bibliotek oraz sekwencjonowania w wybranej konfiguracji.

Sekwencjonowanie NGS przygotowanych przez klienta bibliotek (cały lub częściowy line sekwenatora)

Sekwencjonowanie Sangera

Pakiety: Genomika, Transkryptomika lub Epigenomika (per próbka):

Typ projektu:*

Analiza NGS mikroorganizmów

Transkryptomika organizmów eukariotycznych

Genomika Roślin i Zwierząt

Genomika Ludzi

Epigenomika

Inna usługa

Typ analizy mikroorganizmów:*

Amplicon 16S/18S/ITS

Metagenomics

Whole Bacterial Genome Sequencing (Sekwencjonowanie całego genomu bakterii)

Whole Fungal Genome (Sekwencjonowanie całego genomu grzybów)

16S/18S/ITS/ Platform:*

Illumina,

ONT,

Pac-Bio.

Wybór ONT lub PacBio oznacza wybór sekwencjonowania całego regionu V1-V9 lub ITS.

Illumina (Amplicon 16S/18S/ITS/ Ilumina):*

V3 + V4,

V4,

V4 + V5,

V5 + V7,

ITS1 (do analizy grzybów),

ITS2 (do analizy grzybów),

Inny region.

(można wybrać dwa: jeden do analizy bakterii i jeden do analizy grzybów z jednej próbki)

Region:*

(Proszę wpisać rodzaj regionu)

Podaj liczbę odczytów / tags na próbkę:*Mowa o totalnej ilości odczytów na próbkę tzn. 100k tags = 100k odczytów w sumie (50k odczytów sparowanych).

50K

100K

200K

Pozostałe

Liczba odczytów (tags) na próbkę (Pac-Bio/ONT):*

10K

20K

30K

100K

Pozostałe

Platforma do analizy Metagenomu:*

Illumina

ONT

Pac-Bio

Wybierz potrzebną ilość danych z sekwencjonowania metagenomowego dla próbki (Illumina):*

3 Gb

6 Gb

9 Gb

10 Gb

20 Gb

Pozostałe

Wybierz potrzebną ilość danych z sekwencjonowania metagenomowego dla próbki (ONT/Pac-Bio):*

6 Gb

10 Gb

Pozostałe

Whole Bacterial Genome Sequencing:*

200x, 5 Mbp genome (de novo) – Illumina

100x, >8 Mbp (resequencing) – Illumina

30x HIFI, >8 Mbp genome (resequencing) – Pac-Bio

100x ONT, >8 Mbp genome (resequencing) – Nanopore

Potrzebuję inną konfigurację pakietu

Whole Fungal Genome Sequencing:*

50x, <60 Mbp – survey; Illumina

100x, <60 Mbp – draft; Illumina

100x, <60 Mbp – Hi-C based

30x HiFi, <60 Mbp Fine Genome – Pac-Bio

100x, <60 Mbp – Fine Genome- Nanopore

Potrzebuję inną konfigurację pakietu

Wybierz platformę sekwencjonowania do WGS:*

Illumina

Pac-Bio

ONT

Pozostałe

Potrzebne pokrycie genomu to:*

Hidden

Typ pakietu:

Transkryptomika organizmów eukariotycznych:*

Eucaryotic mRNA Sequencing (polyA enrichment)

lncRNA Sequencing: lncRNAseq + mRNAseq (rRNA depletion)

small RNA Sequencing (rRNA depletion)

circRNA Sequencing (rRNA depletion)

Total RNA Sequencing: smallRNAseq + mRNAseq + lncRNAseq (rRNA depletion)

Full length mRNA Sequencing (Pac-Bio / Nanopore)

Wybierz wymaganą ilość danych z mRNAseq na próbkę (polyA):*

3 Gb (20M reads)

4,5 Gb (30M reads)

6 Gb (40M reads)

7,5 Gb (50M reads)

9 Gb (60M reads)

10 Gb (66M reads)

12 Gb (80M reads)

15 Gb (100M reads)

Pozostałe

Wybierz typ biblioteki do analizy mRNA:*

cDNA

Straded / Directional

Wybierz wymaganą ilość danych z lncRNAseq na próbkę:*

10 Gb

12 Gb

15 Gb

16 Gb

Pozostałe

Wybierz ilość danych ze small RNAseq, która jest wymagana na próbkę:*

10 M SE reads

20 M SE reads

Pozostałe

Wybierz wymaganą ilość danych z circRNAseq?*

16 Gb (minimalna ilość danych na próbkę aby wykryć circRNAs)

Pozostałe

Wybierz wymaganą ilość danych z Total RNAseq (rRNA depleted)?*

4,5 Gb (30M reads)

6 Gb (40M reads)

7,5 Gb (50M reads)

9 Gb (60M reads)

10 Gb (66M reads)

12 Gb (80M reads)

15 Gb (100M reads)

30 Gb (200M reads)

Pozostałe

Wybierz wymaganą ilość danych z full length mRNA-seq (Pac-Bio/ONT):*

4 Gb

6 Gb

12 Gb

20 Gb

40 Gb

Pozostałe

Wybierz platformę do analizy full lenght mRNAseq:*

Pac-Bio

ONT

Hidden

Genomika Roślin i Zwierząt:

Wybierz typ projektu z zakresu Genomiki Roślin i Zwierząt:*

WGS (Whole Genome Seq) – Sekwencjonowanie Całego Genomu

SLAF-seq (Specific locus amplified fragment sequencing – zoptymalizowana procedura ddRADseq.

Wybierz ilość odczytów z sekwencjonowania jednej próbki z SLAF-seq:*

100K tags

200K tags

300K tags

400K tags

Pozostałe

Podaj oczekiwaną ilość danych w gigabajtach z sekwencjonowania jednej próbki [GB]:*

Wybierz platformę do sekwencjonowania WGS:*

Illumina

Pac-Bio

ONT

Pozostałe

Czy analiza GWAS (Genome-Wide Association Studies) jest wymagana?*

Tak

Nie

Hidden

Genomika Ludzi:

Genomika Ludzi:*

Human WES (Whole Exome Seq)

Human WGS (Whole Genome Seq)

Wybierz ilość danych oraz pokrycie exomu z projektu Human WES na próbkę, które są wymagane:*

50x, 5Gb

100x, 10Gb

12Gb Germline Variant Detection

15Gb Somatic Variant Detection

Pozostałe

Wybierz platformę do analizy WGS Human:*

Illumina

ONT

Pac-Bio

BGI

Określ ilość danych oraz pokrycie genomu z projektu Human WGS na próbkę:*

90 Gb, 30x – Germline Variant Detection

240Gb, 80x – Somatic Variant Detection

Pozostałe

Czy potrzebne jest przygotowanie bibliotek z barkodami?*

Tak

Nie

Hidden

Epigenomika:

Epigenomika:*

WGBS

Hi-C

ATAC

WGBS (Epigenomika):

Wybierz organizm, który ma zostać poddany analizie przy użyciu metody WGBS:*

Człowiek / Szczur / Mysz

Roślina / Zwierzę

Podaj ile danych na próbkę i jakie pokrycie genomu jest potrzebne po sekwencjonowaniu (dot.:człowiek / szczur / mysz)?*

30x, 90Gb

30x, 90Gb (low input)

Pozostałe

Podaj ile danych na próbkę i jakie pokrycie genomu jest potrzebne po sekwencjonowaniu (dot.: roślina / zwierzę)*

Low input:*Termin ‘low input’ odnosi się do przypadków, w których konieczne jest zastosowanie specjalnego podejścia do materiału o bardzo niskiej ilości lub koncentracji.

Tak

Nie

Nie dotyczy

Hi-C (Epigenomika):

Podaj ile danych na próbkę jest potrzebne po sekwencjonowaniu [GB] (Hi-C ):*

ATAC (Epigenomika):

Ile danych na próbkę oraz jakie pokrycie genomu Państwo potrzebują po sekwencjonowaniu [M of reads]?*

Inna usługa (typ projektu):

Opisz szczegółowo typ usługi, której potrzebujesz:*

Wybierz preferowaną platformę sekwencjonowania (inna usługa):*

Illumina

Pac-Bio

ONT

Pozostałe

Podaj ile danych na próbkę potrzebujesz (inna usługa) [GB lub M odczytów]:*

Sekwencjonowanie NGS przygotowanych przez klienta bibliotek (cały lub częściowy line sekwenatora)

Podaj nazwę kitu, który zostanie wykorzystany do przygotowania bibliotek do sekwencjonowania:*

Jaki materiał zostanie wykorzystany do przygotowania bibliotek do sekwencjonowania?*

Genomowe DNA

ChIP DNA

RNA

Amplicon

Pojedyncze komórki / jądra komórkowe

Bulk ATAC-seq

Pozostałe

Liczba bibliotek do wysłania:*

Podaj liczbę bibliotek do sekwencjonowania (np. jeżeli zostaną wysłane 3 pule (3 probówki) a w każdej puli 100 bibliotek to suma bibliotek to 300.

Wymagany rozmiar biblioteki (na 1 bibliotekę) [M]:*Na podstawie tej informacji określana jest głębokość sekwencjonowania, inaczej mówiąc ilość danych jakie otrzymasz po sekwencjonowaniu na jedną próbkę.

(Podaj wartość w milionach odczytów.)

Szacunkowa wielkość biblioteki to:*Podaj długość biblioteki (w parach zasad), która zostanie do nas wysłana do sekwencjonowania.

Wybierz konfigurację sekwencjonowania:*

1x50bp

2x150bp

2x250bp

2x300bp

Preferowana platforma sekwencjonowania:*

Illumina

Inna

Nazwa innej niż wymienione platformy do sekwencjonowania:*

Czy próbki zawierają standardowe miejsca wiązania startera sekwencjonującego Illumina?*

Tak, dla obu odczytów Read 1 i Read2

Tak, dla jednego odczytu

Nie

Czy próbki zawierają standardowe miejsca wiązania startera indeksującego Illumina?*

Tak, zawierają pojedyncze sekwencje indeksujące i7 lub jego odpowiednik;

Tak, zawierają podwójne sekwencje indeksujące i5 i i7 lub ich odpowiedniki;

Tak, ale nie dodaliśmy żadnych sekwencji indeksujących;

Nie

Jakiej długości są indeksy?*

6bp (większość pojedynczych indeksów /single index),

8bp (większość podwójnych indeksów /dual index),

10bp,

16bp,

24bp,

Pozostałe

Czy potrzebny jest PhiX spike-in?*

Tak

Nie

Wskaż stopień różnorodności bibliotek:*

Wysoki poziom różnorodności,

Niski poziom różnorodności.

Sekwencjonowanie Sangera

Próbki zostaną przesłane:*

w probówkach typu Eppendorf,

na płytkach 96 dołkowych.

Czy próbki będą zmieszane z starterem (tzw. premix)?*

Tak, próbki będą zmieszane.

Nie, starter zostanie dostarczony w osobnej probówce.

Hidden

Wspólne pytania:

Uzupełniające pytania:

Dodatkowe informacje:

Im bardziej szczegółowe informacje uzyskamy od Ciebie, tym skuteczniej dostosujemy naszą ofertę do Twoich potrzeb. Każde zapytanie traktujemy indywidualnie, dążąc do znalezienia idealnego rozwiązania spełniającego wszystkie Twoje oczekiwania.

Hidden

Czy potrzebujesz pomocy technicznej?

Czy potrzebujesz pomocy technicznej w sprawie niniejszego zapytania?*

Tak

Nie

Powiedz nam, jak możemy Ci pomóc?

Hidden

Sekcja 3 – dodatkowe informacje:

Czy usługa powinna zawierać również izolację kwasów nukleinowych z dostarczonych próbek?*

Tak

Nie

Jaki materiał zostanie wysłany do izolacji:*

(np. tkanki / komórki / pelet / FFPE / krew itp.)

Czy usługa powinna zawierać również analizę bioinformatyczną danych po sekwencjonowaniu?*

Tak

Nie

Oczekiwania względem analizy bioinformatycznej:

Co powinna zawierać analiza? Podaj swoje oczekiwania względem analizy.

Podaj ilość próbek do analizy:*

Wpisz liczbę większą lub równą 1.

W tym polu należy podać liczbę indywidualnych probówek, które zostaną wysłane do laboratorium. W każdej z probówek może znajdować się pojedyncza próbka, biblioteka lub pula bibliotek.

Czy wszystkie próbki zostaną wysłane w jednej przesyłce?*

Tak, próbki zostaną wysłane wszystkie na raz.

Nie, próbki zostaną wysłane w transzach.

Podaj ilość transz:*

Wpisz liczbę od 1 do 500.

Do każdej transzy próbek zostanie doliczony koszt transportu materiału oraz dostawy danych.

Wpisz badany gatunek:*

(wymagana nazwa łacińska)

Podaj wielkość genomu analizowanego organizmu:*

Czy w próbkach będzie znajdować się materiał infekcyjny lub wirusowy?*

Tak

Nie

Jaki rodzaj materiału infekcyjnego lub wirusowego może znajdować się w próbkach?*

Wybierz preferowany sposób dostarczenia danych po usłudze:*

Prywatny link z dostępem do danych w szyfrowanym folderze online.

Zewnętrzny dysk (Rekomendowane dla wszystkich projektów których ilość danych końcowych przekroczy 500Gb.)

Przeznaczenie projektu:*

Badawcze

Kliniczne

Czy usługa będzie realizowana na zasadach zamówienia publicznego?*

Nie

Tak, ale szczegóły nie zostały jeszcze opublikowane.

Tak, zapytanie zostało już opublikowane.

Szczegóły zapytania publicznego:

Adres strony internetowej z opublikowanym zapytaniem:

Szczegóły zapytania:

Maks. rozmiar pliku: 2 GB.

Zapytanie jest ważne do dnia:

RRRR myślnik MM myślnik DD

Czy w trakcie wypełniania formularza pojawiły się jakieś wątpliwości, które wymagają wsparcia technicznego?*

Tak

Nie

Opisz wątpliwości wymagające wsparcia technicznego:*

Dodatkowe informacje:

Płatność:

Wybierając przedpłatę 100% na fakturę zaliczkową, otrzymają Państwo najlepszą ofertę. Więcej na ten temat znajdziesz na naszej stronie internetowej: https://weseq.it/baza_wiedzy/metody-platnosci/ .

Wybierz preferowaną formę płatności:*

PrzedpłataZyskaj dostęp do naszej najkorzystniejszej oferty cenowej, dokonując przedpłaty.

Płatność po wykonaniu usługi

Oferujemy trzy opcje płatności oparte na zasadach przedpłaty:*

Na zasadach faktury zaliczkowej. (standard)Faktura zaliczkowa zostanie wystawiona po otrzymaniu płatności. Faktura końcowa zostanie wystawiona po wykonaniu usługi.

Faktura wystawiona po odbiorze próbek.Ta opcja jest dla klientów, którzy potrzebują pilnie faktury.

Płatność Bonem.

Więcej na ten temat znajdziesz w naszej bazie wiedzy: https://weseq.it/baza_wiedzy/metody-platnosci/

Dołącz bon:*

Maks. rozmiar pliku: 2 GB.

Podaj kod bonu:*

Czy posiadasz voucher?*

Tak

Nie

Podaj kod vouchera:*

Skąd dowiedziałeś się o weSEQ.IT?*

z wyszukiwarki internetowej;

z mediów społecznościowych;

z polecenia;

z konferencji / szkolenia;

z wiadomości email;

od opiekuna klienta;

jestem już klientem weSEQ.IT;

Pozostałe

Kto nas polecił?*

Dzięki tej informacji będziemy mogli podziękować osobie, która nas poleciła.

Oceń w skali szkolnej czytelność i łatwość korzystania z formularza:*

6 – celujący

5 – bardzo dobry

4 – dobry

3 – dostateczny

2 – dopuszczający

1 – niedostateczny

Napisz co możemy ulepszyć:

Doceniamy Twoje opinie i uwagi. Chcemy się rozwijać i poprawiać nasze usługi. Dlatego bardzo zależy nam na Twojej informacji zwrotnej.