Analiza bioinformatyczna

Wychodząc naprzeciw Państwa potrzebom oferujemy również analizę bioinformatyczną uzyskanych wyników dopasowaną do przeprowadzonego sekwencjonowania, materiału wyjściowego oraz stawianych hipotez badawczych.

Czym jest analiza bioinformatyczna?

Analiza bioinformatyczna to potężne narzędzie, które pozwala na interpretację danych z sekwencjonowania. Samo sekwencjonowanie generuje ogromne ilości danych, w postaci odczytów w parach zasad - sekwencji. Odpowiednie zastosowanie różnego rodzaju narzędzi bioinformatycznych pozwala na odkrycie cennych informacji ukrytych w surowych danych sekwencjonowania, m.in. takich jak:

Każda nasza usługa sekwencjonowania w weSEQ.IT zawiera podstawową analizę bioinformatyczną, która obejmuje analizę jakości danych po sekwencjonowaniu.

Na życzenie klienta w cenie usługi sekwencjonowania możemy również przeprowadzić:

• Trimming sekwencji adaptorów - usunięcie z odczytów surowych sekwencji adaptorów wykorzystanych do sekwencjonowania;
• Dostarczenie wyników w postaci oczyszczonych danych (tzw. clean reads)
  

Zaawansowana analiza bioinformatyczna (dodatkowo płatna): różni się w zależności od wybranego rodzaju sekwencjonowania i może być dostosowywana do potrzeb projektu, a obejmować może m.in.:

• Badanie struktury i funkcji genomu, montaż genomu (z ang. Genom Assembly, również z opcją 0-gap) wraz z SNP i InDel calling jako wynik sekwencjonowania WGS
• Identyfikację SNP/InDel i nowych genów oraz różnych ich wariantów; różnicową analizę ekspresji genów (DEGs) oraz analizę funkcjonalną genów o zmienionej ekspresji (GO) jako wynik sekwencjonowania transkryptomu RNA-seq.
• Identyfikację nowych małych cząsteczek RNA, analizę zmian ekspresji smallRNA oraz adnotacje i funkcjonalne analizy genów docelowych analizowanych sRNA jako wynik sekwencjonowania small RNA-seq.
• Analizę Operational Taxonomic Unit (OTU), dystrubucję gatunkową oraz analizę Alpha i Beta diveristy wraz z porównaniami pomiędzy próbkami jako elementy analizy bioinformatycznej sekwencjonowania Amplicon Seq 16S rRNA.

Dlaczego warto skorzystać z naszych usług analizy bioinformatycznej?

• Dostarczymy wyniki analiz bioinformatycznych w postaci gotowych do wykorzystania w publikacji:
  • tabel, 
  • wykresów,
  • heatmap,
  • schematów,
  • dokładnych opisów zastosowanych narzędzi i metod.
• Analizę przeprowadzi dla Państwa doświadczony zespół bioinformatyków;
• Dzięki opracowanym i sprawdzonym pipline (procedurom) gwarantujemy szybką, rzetelną i wiarygodną analizę;
• Konkurencyjne ceny;
• Dajemy możliwość dostosowania analizy do indywidualnych potrzeb.
• Wyniki przesłane w postaci tabel oraz plików tekstowych są w wersji edytowalnej, tak aby mogli Państwo zawsze do nich wrócić i wyciągnąć interesujące w danym momencie dane.
  

Rekomendujemy aby wskazać konkretne wymagania stawiane analizie bioinformatycznej podczas uzupełniania formularza specyfikacji projektu.

Zakres analizy można również przedyskutować / uzgodnić z Naszym Działem wsparcia który odpowie na pojawiające się pytania i wątpliwości.

Poniżej przedstawiamy przykładowe Raporty Demo z analizy mRNA-seq, small RNA-seq oraz WGS.

Skontaktuj się z nami już dziś, aby dowiedzieć się więcej o naszych usługach analizy bioinformatycznej!