Transcriptome Sequencing

Celem poznania sekwencji transkryptomu oferujemy różne podejścia w zależności od stawianych hipotez badawczych:

– Total RNA (biblioteki tworzone metodą rRNA depletion oraz zestawem dedykowanym dla small RNAseq)
– mRNA (biblioteki tworzone metodą polyA lub stranded mRNA)
– small RNA (biblioteki tworzone zestawem dedykowanym do smallRNAseq)
– lncRNA (biblioteki tworzone metodą rRNA depletion)
– circRNA Sequencing (biblioteki tworzone metodą rRNA depletion)
– full-length transcript (Iso-Seq)

– Prokaryotic RNAseq (biblioteki tworzone metodą rRNA depletion)

Rodzaje rozwiązań celem tworzenia bibliotek:

• rRNA depletion – oparte jest o usunięcie rybosomalnego RNA w wyniku czego w materiale pozostaje zarówno mRNA, lncRNA, circRNA jak i smallRNA. Rozwiązanie to dedykowane jest również do badań organizmów prokariotycznych których transkrypty nie zawierają ogonów polyA.
• polyA enrichment– oparte o wyłapywanie z materiału genetycznego tylko tych transkryptów które zawierają ogony polyA, czyli transkryptów mRNA. Podejście zalecane gdy celem projektu jest poznanie różnic w ekspresji genów badanego organizmu.
• stranded mRNA – pozwala na precyzyjne określenie orientacji nici mRNA w celu wykrycia transkryptów antysensownych, alternatywnych transkryptów, fuzji genów oraz ekspresja specyficznych dla konkretnych alleli.

Celem poznania cen oferowanych usług zalecamy wypełnienie formularza specyfikacji projektu i/lub zapoznanie się z artykułem dotyczącym wyceny usług.