Informację o wykonawcy usługi należy umieścić w sekcji Materials and Methods / Methods.
Wybierz wyłącznie etapy rzeczywiście wykonane w Twoim projekcie. Spójny zapis nazwy weSEQ.IT oraz identyfikatora ROR ułatwia jednoznaczną identyfikację wykonawcy usługi. Jeśli nie znasz któregoś parametru, sprawdź Raport projektu lub skontaktuj się z nami - nie zgaduj.
Dane weSEQ.IT do publikacji
W publikacji używaj dokładnej nazwy weSEQ.IT, łącznie z końcówką „.IT”. Nie skracaj nazwy ani nie zmieniaj jej zapisu. weSEQ.IT należy wskazywać jako wykonawcę lub dostawcę usługi, a nie jako afiliację autora, chyba że dany autor rzeczywiście jest afiliowany z weSEQ.IT.
Wybierz zakres usługi
Wybierz wariant odpowiadający rzeczywistemu zakresowi usługi. Informacje w nawiasach kwadratowych uzupełnij na podstawie Raportu projektu. Jeżeli czasopismo nie pozwala na podanie ROR lub adresu URL w tekście, pomiń identyfikator ROR.
Tylko sekwencjonowanie
Sequencing services were provided by weSEQ.IT (Rybnik, Poland; ROR: https://ror.org/0458mee09) using the [INSTRUMENT] platform with [READ CONFIGURATION, e.g. 2 × 150 bp paired-end reads] configuration.
Uzupełnij:
- [INSTRUMENT] - wykorzystana platforma sekwencjonowania wraz z modelem sekwenatora np. Illumina NovaSeq X
- [READ CONFIGURATION] - parametry sekwencjonowania tj. długość odczytów i tryb sekwencjonowania, np. 2x150 (UWAGA! Nie dla wszystkich platform ma ten punkt zastosowanie.)
Przygotowanie bibliotek i sekwencjonowanie
Sequencing libraries were prepared using [LIBRARY PREPARATION KIT] according to the manufacturer’s instructions and sequenced on the [INSTRUMENT] platform using a [READ CONFIGURATION] configuration. Library preparation and sequencing were performed by weSEQ.IT (Rybnik, Poland; ROR ID: https://ror.org/0458mee09).
Uzupełnij:
- [LIBRARY PREPARATION KIT] - zestaw do przygotowania bibliotek i jego producent
- [INSTRUMENT] - wykorzystana platforma sekwencjonowania wraz z modelem sekwenatora np. Illumina NovaSeq X
- [READ CONFIGURATION] - parametry sekwencjonowania tj. długość odczytów i tryb sekwencjonowania, np. 2x150 (UWAGA! Nie dla wszystkich platform ma ten punkt zastosowanie.)
Tylko analiza bioinformatyczna
Bioinformatics services were provided by weSEQ.IT (Rybnik, Poland; ROR: https://ror.org/0458mee09). The analysis included [SCOPE OF ANALYSIS] using [SOFTWARE AND VERSION] and [REFERENCE GENOME / ASSEMBLY / ANNOTATION OR DATABASE AND VERSION], where applicable.
Uzupełnij:
- [SCOPE OF ANALYSIS] - zakres wykonanej analizy
- [SOFTWARE AND VERSION] - oprogramowanie i jego wersja
- [REFERENCE GENOME / ASSEMBLY / ANNOTATION OR DATABASE AND VERSION] - genom referencyjny, assembly, adnotacja lub baza danych i ich wersja, jeśli dotyczy
Wskazanie weSEQ.IT nie zastępuje wymaganych cytowań wykorzystanego oprogramowania, metod, baz danych lub publikacji referencyjnych.
Sekwencjonowanie i analiza bioinformatyczna
Sequencing services were provided by weSEQ.IT (Rybnik, Poland; ROR: https://ror.org/0458mee09) using the [INSTRUMENT] platform with [READ CONFIGURATION] configuration. Bioinformatics analysis included [SCOPE OF ANALYSIS] using [SOFTWARE AND VERSION] and [REFERENCE GENOME / ASSEMBLY / ANNOTATION OR DATABASE AND VERSION], where applicable.
Przygotowanie bibliotek, sekwencjonowanie i analiza bioinformatyczna
Sequencing libraries were prepared using [LIBRARY PREPARATION KIT] according to the manufacturer’s instructions and sequenced on the [INSTRUMENT] platform using a [READ CONFIGURATION] configuration. Bioinformatics analysis included [SCOPE OF ANALYSIS] using [SOFTWARE AND VERSION] and [REFERENCE GENOME / ASSEMBLY / ANNOTATION OR DATABASE AND VERSION], where applicable. Library preparation, sequencing and bioinformatic analysis were performed by weSEQ.IT (Rybnik, Poland; ROR ID: https://ror.org/0458mee09).
Opis musi odpowiadać rzeczywistemu sposobowi realizacji projektu. Zastosuj opis zgodny z Raportem projektu i zakresem zleconej usługi.
Co, jeśli weSEQ.IT wykonywało również inne etapy?
Jeśli zakres projektu obejmował inne/dodatkowe etapy, np. izolację kwasów nukleinowych, niestandardowe przygotowanie bibliotek lub bardziej rozbudowaną analizę bioinformatyczną, opis metody powinien odpowiadać rzeczywistemu zakresowi projektu. Szczegóły znajdują się w raporcie otrzymanym wraz z wynikami projektu. Jeżeli nie możesz ich znaleźć, podaj nam numer projektu, a pomożemy wskazać właściwe informacje techniczne do publikacji.
Skąd wziąć parametry projektu?
Informacje potrzebne do przygotowania opisu metody znajdziesz w Raporcie z projektu, który w zależności od zakresu usługi zawiera informacje o instrumencie/platformie sekwencjonującej, konfiguracji odczytów, zestawie i metodzie przygotowania bibliotek, sekwencjach adapterów, zakresie analizy bioinformatycznej, zastosowanym oprogramowaniu i jego wersjach oraz genomie referencyjnym, wersji assembly i adnotacji lub odpowiedniej bazie danych. Jeśli któregoś parametru nie ma w Raporcie, skontaktuj się z nami - nie zgaduj.
Opis wykonawcy nie zastępuje opisu metody. W publikacji należy podać parametry techniczne potrzebne do zrozumienia i odtworzenia eksperymentu.
Acknowledgements - opcjonalnie
Informację o wykonawcy najlepiej umieścić przede wszystkim w Materials and Methods. Jeśli chcesz dodatkowo wymienić weSEQ.IT w sekcji Acknowledgements, możesz użyć:
The authors acknowledge weSEQ.IT (Rybnik, Poland; ROR: https://ror.org/0458mee09) for [LIBRARY PREPARATION / SEQUENCING / BIOINFORMATICS ANALYSIS] services.
Acknowledgements są opcjonalne. Usuń z nawiasu etapy, które nie były częścią projektu, i dostosuj zapis do zasad wybranego czasopisma.
Najczęstsze pytania
Czy muszę podawać pełną nazwę prawną firmy?
Nie. W publikacji stosuj nazwę weSEQ.IT. Nazwę prawną podajemy wyżej wyłącznie informacyjnie.
Czy muszę podawać ROR?
Nie zawsze. ROR jest trwałym identyfikatorem organizacji i zalecamy jego użycie, jeśli format czasopisma pozwala na podanie identyfikatora lub adresu URL. Preferowana postać to https://ror.org/0458mee09.
Czy weSEQ.IT należy wpisać jako afiliację autora?
Nie, chyba że dany autor rzeczywiście jest afiliowany z weSEQ.IT. W pozostałych przypadkach weSEQ.IT należy wskazać jako wykonawcę usługi w Methods lub opcjonalnie w Acknowledgements.
Czy wykonanie usługi przez weSEQ.IT oznacza współautorstwo publikacji?
Nie automatycznie. Samo wykonanie usługi technicznej nie przesądza o współautorstwie. Jeżeli konkretna osoba z weSEQ.IT wniosła istotny wkład naukowy, autorstwo należy ocenić zgodnie z polityką autorstwa i kryteriami stosowanymi przez dane czasopismo.
Czy wystarczy wymienić weSEQ.IT w Acknowledgements?
Jeżeli informacja o wykonanej usłudze jest istotna dla odtworzenia eksperymentu, zalecamy opisanie jej przede wszystkim w Materials and Methods. Acknowledgements mogą stanowić dodatkowe podziękowanie.
Nie wiem, jakiego urządzenia, zestawu lub wersji oprogramowania użyto. Co zrobić?
Sprawdź Raport projektu. Jeśli potrzebnej informacji tam nie ma, podaj nam numer projektu - pomożemy ustalić właściwy zapis.
Chcesz zweryfikować opis naszej usługi?
Prześlij numer projektu oraz fragment dotyczący usługi weSEQ.IT. Sprawdzimy jego zgodność z zakresem i dokumentacją techniczną projektu. Nie musisz przesyłać całego manuskryptu.
Publikacja jest już dostępna?
Prześlij DOI lub link do pracy, w której wykorzystano wyniki projektu weSEQ.IT.
Dziękujemy - pomaga nam to dokumentować wykorzystanie danych wygenerowanych dla naszych klientów w badaniach naukowych.
Treść powyższych wzorów można kopiować i dostosowywać do własnej publikacji oraz wymagań czasopisma.