Metody sekwencjonowania

Amplicon Seq czy metagenomika shotgun? Którą metodę wybrać?

Porównaj Amplicon Seq i Metagenomikę shotgun: zakres usług, zastosowanie, podobieństwa i różnice, aby świadomie dokonać wyboru metody dopasowanej do celu badania.

mRNA-seq czy Total RNA-seq? Którą metodę wybrać?

Poznaj najważniejsze różnice między mRNA-seq z selekcją Poly(A) a Total RNA-seq z deplecją rRNA, ich zastosowania i zakres analizowanych transkryptów, aby wybrać metodę przygotowania bibliotek najlepiej dopasowaną do celu badania i rodzaju materiału biologicznego.

Illumina, PacBio czy Oxford Nanopore? Którą technologię wybrać?

Poznaj najważniejsze różnice między technologiami sekwencjonowania Illumina, PacBio HiFi i Oxford Nanopore, ich zastosowania oraz możliwości analityczne, aby wybrać platformę lub podejście hybrydowe najlepiej dopasowane do celu badania, wymagań jakościowych i budżetu projektu.

De novo genome assembly - Illumina, PacBio, Nanopore czy hybryda?

Dowiedz się, którą technologię sekwencjonowania: Illumina, PacBio HiFi, Oxford Nanopore czy podejście hybrydowe, wybrać do składania genomu de novo oraz jak wpływa ona na jakość, kompletność i koszt uzyskania sekwencji genomowej.

WGS, WES czy panel genowy? Którą metodę wybrać?

Poznaj najważniejsze różnice między WGS, WES i sekwencjonowaniem paneli genowych, ich zastosowania oraz możliwości wykrywania wariantów genetycznych, aby wybrać metodę najlepiej dopasowaną do celu badania, wymaganej czułości i budżetu projektu.

Metatranskryptomika w badaniach aktywności mikrobiomu

Poznaj najważniejsze różnice między metagenomiką a metatranskryptomiką, ich zastosowania i możliwości analityczne, aby wybrać metodę sekwencjonowania najlepiej dopasowaną do celu Twojego badania.

Whole Genome Sequencing WGS sekwencjonowanie całego genomu

Whole Genome Sequencing to zaawansowana metoda sekwencjonowania, która pozwala na określenie pełnej sekwencji genomu organizmu.

Human WGSPlant and Animal WGSBacterial and Fungal WGS

Whole Exome Sequencing WES sekwencjonowanie całego eksomu

Whole Exome Sequencing, czyli sekwencjonowanie całego eksomu, to metoda umożliwiająca analizę regionów kodujących białka, eksonów oraz przylegających do nich sekwencji.

Genotyping & Reduced Representation Sequencing genotypowanie i sekwencjonowanie reprezentatywnych fragmentów genomu

Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing SLAF-seq

Messenger RNA Sequencing mRNA-seq sekwencjonowanie mRNA

Frakcja mRNA z ogonami poli(A). Wybierasz, gdy interesuje Cię ekspresja genów.

Total RNA Sequencing total RNA-seq sekwencjonowanie z deplecją rRNA

Po usunięciu rybosomalnego RNA w danych zostają mRNA, lncRNA i circRNA.

Small RNA Sequencing small RNA-seq sekwencjonowanie krótkich RNA

Full-Length Transcriptome Sequencing transkrypty pełnej długości

Odczyt transkryptów na całej ich długości, dzięki czemu rozróżniasz izoformy powstające z tego samego genu.

Prokaryotic RNA Sequencing RNA-seq transkryptom prokariotów

Analiza ekspresji genów u bakterii, z deplecją rRNA dopasowaną do materiału prokariotycznego.

Whole-Genome Bisulfite Sequencing WGBS metylacja DNA

Odczyt metylacji DNA w całym genomie, z rozdzielczością pojedynczej zasady.

Assay for Transposase-Accessible Chromatin with Sequencing ATAC-seq dostępność chromatyny

Mapowanie otwartych regionów chromatyny, czyli miejsc, w których genom jest dostępny dla czynników regulujących ekspresję.

High-Throughput Chromosome Conformation Capture Hi-C przestrzenna organizacja genomu

Analiza kontaktów przestrzennych w genomie: które odcinki DNA są blisko siebie w jądrze komórkowym.

ChIP-seq

Sprawdź, jak identyfikować miejsca wiązania białek do DNA, analizować modyfikacje histonów oraz jakie próbki, parametry sekwencjonowania i analizy obejmuje usługa.

Amplicon Sequencing sekwencjonowanie amplikonów

Targeted 16S rRNA Gene and Internal Transcribed Spacer (ITS) Amplicon SequencingFull-Length 16S rRNA Gene and ITS Amplicon Sequencing

Shotgun Metagenomic Sequencing metagenomika shotgun

Metatranscriptomic Seq

Sprawdź, jak analizować ekspresję genów społeczności mikroorganizmów oraz jakie próbki, parametry sekwencjonowania i analizy obejmuje usługa.

10x Genomics Single-Cell RNA Sequencing scRNA-seq ekspresja w pojedynczych komórkach

10x Genomics Single-Cell ATAC Sequencing scATAC-seq dostępność chromatyny w pojedynczych komórkach

Spatial Transcriptomics ST transkryptomika przestrzenna

Sekwencjonowanie bibliotek (Pre-made Libraries)

Dla badaczy, którzy przygotowują biblioteki NGS samodzielnie i potrzebują tylko sekwencjonowania.