Article Category: Usługi NGS
Jak wygląda współpraca z weSEQ.IT: od wyceny i zamówienia, przez kontrolę jakości i sekwencjonowanie, po analizę bioinformatyczną. Znajdziesz tu również odpowiedzi na pytania, które wracają najczęściej przy planowaniu projektu: ile danych zamówić, ile trwa realizacja i którą platformę wybrać.
- Home
- Knowledge Base
- Usługi NGS
Usługi NGS
Jak wygląda współpraca z weSEQ.IT: od wyceny i zamówienia, przez kontrolę jakości i sekwencjonowanie, po analizę bioinformatyczną. Znajdziesz tu również odpowiedzi na pytania, które wracają najczęściej przy planowaniu projektu: ile danych zamówić, ile trwa realizacja i którą platformę wybrać.
Lista usług NGS
21 ArticlesKatalog metod sekwencjonowania w pięciu obszarach badawczych: genomika, transkryptomika, epigenomika, mikrobiom i analizy pojedynczych komórek. Opisy pojedynczych usług, a nie odpowiedzi na pytania o przebieg współpracy.
Przebieg procesu realizacji usług sekwencjonowania
Krok po kroku, co dzieje się z próbką w laboratorium i po czyjej stronie leży każdy etap, od izolacji po przekazanie wyników.
Przebieg procesu zamówienia usług NGS
Ścieżka od zapytania do zlecenia: oferta wstępna, jej akceptacja i formalności, z zaznaczeniem, kto odpowiada za każdy krok.
Wycena usług sekwencjonowania
Od czego zależy cena projektu i jakie informacje musimy znać, żeby przygotować wycenę.
Ilość danych z sekwencjonowania
Output, pokrycie, głębokość sekwencjonowania i liczba odczytów: co znaczą te parametry i ile danych zamówić do swojego projektu.
Analiza jakości (QC)
Trzy etapy kontroli jakości: próbki dostarczone przez klienta, biblioteki po syntezie i dane po sekwencjonowaniu.
Kryteria oceny jakości dostarczonego RNA/DNA
Czterostopniowa skala A-D, według której kwalifikujemy każdą próbkę przed przygotowaniem bibliotek.
Analiza bioinformatyczna
Czym jest analiza bioinformatyczna i jak dobieramy ją do materiału, metody sekwencjonowania oraz hipotezy badawczej.
Świadczone usługi NGS
Przegląd świadczonych usług sekwencjonowania i sprzętu, na którym je realizujemy.
Czas realizacji usługi (TAT)
Od czego zależy termin realizacji i dlaczego podajemy go dopiero po poznaniu szczegółów projektu.
Porównanie: Illumina i AVITI
Czym różnią się obie platformy pod względem technologii, parametrów i doświadczenia rynkowego, gdy wybierasz sprzęt do projektu.
Obsługa posprzedażowa
Z czym możesz się do nas zgłosić po odebraniu wyników, na etapie pisania manuskryptu albo odpowiedzi na recenzje.
Izolacja DNA lub RNA
Usługa izolacji kwasów nukleinowych z dostarczonego materiału, gdy chcesz oddać ten etap w nasze ręce.
Pakiet interwencyjny QC - Backup
Zabezpieczenie projektu na trudnym materiale i wtedy, gdy nie możesz sprawdzić jakości próbek przed wysyłką.
Metatranskryptomika czy Prokaryotic RNAseq? Co wybrać?
Czym różnią się obie techniki i którą wybrać w zależności od celu badania.
GENOMICS
W SKRÓCIE –Usługi genomiczne dzielimy na trzy grupy: WGS, WES oraz genotypowanie i sekwencjonowanie zredukowanej reprezentacji genomu. –Sekwencjonujemy genomy roślin, zwierząt...
10x Genomics RNA-seq
W SKRÓCIE –Metoda mierzy ekspresję genów w rozdzielczości pojedynczej komórki lub jądra, zamiast uśrednionego profilu całej próbki. –System 10x Genomics Chromium...
English 
Polish