Doba zpracování zakázky závisí na mnoha proměnných, a proto ji nelze určit bez znalosti podrobností plánované analýzy.
Doba zpracování zakázky (z anglického Turnaround time (TAT)) závisí mimo jiné na:
NA ČEM ZÁLEŽÍ4 faktory
rozsahu zakázkytedy zda zakázka zahrnuje izolaci nukleových kyselin, přípravu knihoven, sekvenování a bioinformatickou analýzu? Nebo snad jen sekvenování? Každá fáze vyžaduje určitý čas, a proto čím je objednávka složitější, tím delší je doba jejího zpracování.
typu analýzyProtože různé služby vyžadují použití různých přístrojů, závisí doba vyřízení objednávky také na typu analýzy, například vyřízení objednávky na sekvenování malých RNA obvykle trvá o několik dní déle než vyřízení objednávky na sekvenování mRNA.
způsobu předání výsledkůa na množství výsledných dat projektu. Čím více dat projekt obsahuje, tím více času je potřeba na jejich přípravu a zpřístupnění. Pokud mají být výsledky projektu zaslány poštou, je třeba připočítat také dobu doručení externího disku.
kvalitě dodaného materiáluk analýze. Kvalita vzorků je velmi důležitým faktorem při vyřizování objednávky a výrazně ovlivňuje dobu zpracování zakázky. Pokud byť jediný ze vzorků dodaných k analýze nesplní požadavky na kvalitu ověřované při kontrole kvality (QC) a podle kritérií kvality nebude schválen pro přípravu knihoven, analýza se pozastaví do rozhodnutí zákazníka o dalším postupu s daným vzorkem.
SOUVISEJÍCÍ ČLÁNKY
Cenová nabídka sekvenačních služebMnožství dat ze sekvenováníBioinformatická analýzaFormulář bioinformatické analýzyPrůběh objednávání služeb NGSKolik stojí RNA-seq a na čem závisí cena projektu?KLÍČOVÁ SLOVA
TATturnaround timedoba zpracovánítermín
Byl vám tento článek užitečný?
Vaše odpověď nám pomáhá zlepšovat znalostní bázi.
Děkujeme - pomáhá nám to.
Děkujeme. Co chybělo?
Stačí jedna věta - dostane se k osobě, která má tento článek na starosti.
Děkujeme za připomínku.