Sekvenování DNA a RNA
Od vzorku k datům připraveným k publikaci.
Zajišťujeme celý proces - od izolace materiálu přes přípravu knihoven a sekvenování NGS a TGS až po pokročilou bioinformatickou analýzu.
SEKVENOVÁNÍ JE NAŠE SPECIALIZACE
Objednejte si sekvenování DNA nebo RNA.
Specializujeme se na sekvenování nové generace (NGS) s krátkými čteními a třetí generace (TGS) s dlouhými čteními. Nabízíme sekvenování na platformách Illumina, PacBio a Oxford Nanopore Technologies na nejnovějších sekvenátorech, jako jsou Illumina NovaSeq X Plus či PacBio Revio.
U nás můžete zkoumat transkriptom, genom, epigenom i mikrobiom a provádět analýzy jednotlivých buněk. Kromě sekvenování vám poradíme při plánování experimentu a provedeme komplexní bioinformatickou analýzu získaných výsledků.
NAŠE SEKVENAČNÍ SLUŽBY
Kompletní nabídka našich služeb.
Od izolace materiálu přes přípravu knihoven až po bioinformatickou analýzu s daty připravenými k publikaci.
- Celogenomové sekvenování
- Celoexomové sekvenování
- Genotypizace & sekvenování redukované reprezentace genomu
EPIGENOMIKA &
3D GENOM
Analýza regulace genomu, přístupnosti chromatinu a jeho prostorového uspořádání
MIKROBIOM & METAGENOMIKA
Charakterizace mikroorganismů a jejich funkčního potenciálu v komplexních vzorcích
JEDNOBUNĚČNÁ &
PROSTOROVÁ OMIKA
Analýza heterogenity buněk a buněčných jader a prostorové organizace genové exprese
Nenašli jste metodu, kterou potřebujete?
Představte nám svůj projekt a my se pokusíme najít vhodné řešení.
Komplexní přístup
Celý projekt na jednom místě.
Izolace genetického materiálu
Provádíme izolaci DNA a RNA z téměř všech druhů biologického materiálu - od standardních vzorků až po mimořádně náročný materiál. Specializujeme se také na práci s degradovanými vzorky a vzorky s velmi nízkým obsahem genetického materiálu. Pracujeme rovněž s materiálem vysoké vědecké hodnoty, jako jsou fosilie nebo historické vzorky.
Každou izolaci provádí zkušený tým s využitím validovaných metod a důsledné kontroly kvality.
Po dokončení analýz obdržíte zprávu s hodnocením kvality a množství izolovaného materiálu.
Více o izolaci DNA a RNA
Příprava knihoven pro sekvenování
Každá analýza NGS začíná přípravou knihovny DNA nebo RNA. V této fázi se genetický materiál přesně upravuje do podoby kompatibilní se sekvenační platformou pomocí fragmentace, ligace adaptérů a podle konkrétního projektu také amplifikace a purifikace.
Proces vychází z validovaných protokolů a vysoké míry automatizace, což snižuje riziko lidské chyby a zajišťuje maximální reprodukovatelnost i kvalitu vstupních dat.
Bioinformatická analýza
Po dokončení sekvenování získáváme rozsáhlé a složité datové soubory, které vyžadují odborné zpracování a správnou interpretaci. Náš tým bioinformatiků analyzuje data z vašich vzorků a převádí je do srozumitelných, přehledných a využitelných výsledků.
V závislosti na typu projektu může analýza zahrnovat mimo jiné identifikaci genů a transkriptů, detekci variant a mutací, hodnocení genetické variability a struktury genomu, analýzu genové exprese, charakterizaci složení mikrobiomu i porovnání vzorků nebo zkoumaných skupin.
Každý projekt završujeme přípravou přehledné zprávy obsahující popis použitých metod, výsledky, tabulky a vhodně zvolené vizualizace, například grafy, schémata nebo tepelné mapy. Získané podklady jsou připravené k využití v publikacích a mohou sloužit také jako základ pro další interpretaci výsledků nebo navazující analýzy.
Více o bioinformatické analýzeSekvenujeme na přístrojích
nejnovější generace.
Bezpečnost a kvalita
Vaše vzorky pod kontrolou v každé fázi.
- Kontrola po příjmu vzorkůOvěřujeme stav, koncentraci a integritu dodaného genetického materiálu.
- Automatizovaná izolaceAutomatizujeme izolaci, abychom omezili lidské chyby a zajistili reprodukovatelné výsledky.
- Kontrola po přípravě knihovenPřed sekvenováním ověřujeme kvalitu knihoven.
- Kontrola po sekvenováníPřed zpřístupněním dat kontrolujeme kvalitu čtení.
„Společnost weSEQ.IT založili vědci pro vědce.“
Nejsme mezinárodní korporace - o to víc se snažíme.
Specializujeme se výhradně na sekvenování a ke každému projektu přistupujeme individuálně.
Proč weSEQ.IT?
6 důvodů, proč využít služeb weSEQ.IT.
Důkladné zmapování potřeb
Náš interaktivní systém pomáhá přesně určit potřeby projektu a zvolit vhodnou specifikaci - začátečníkům v oblasti NGS i zkušeným výzkumným týmům. Seznamte se s naším systémem.
Komplexní bioinformatické analýzy
Zprávy obsahují tabulky, grafy a schémata připravené k použití v publikaci. Pro každý projekt volíme vhodné nástroje a metody analýzy podle jeho cílů. Seznamte se s našimi bioinformatickými analýzami.
Možnost výběru nejlepších vzorků
Intervenční balíček umožňuje zaslat k analýze větší počet vzorků. Na základě výsledků QC vyberete vzorky nejvyšší kvality, a zvýšíte tak šanci na co nejlepší výsledky sekvenování. Seznamte se s naším intervenčním balíčkem.
Individuální přístup a podpora v každém kroku
Ke každému projektu přistupujeme individuálně - od výběru vhodné specifikace přes realizaci až po podporu po jeho dokončení. Domluvte si schůzku a seznamte se s naším technickým týmem.
Podpora po obdržení výsledků
I po předání výsledků se můžete spolehnout na naši podporu. Pro naše zákazníky průběžně rozšiřujeme znalostní bázi, ve které najdete řadu odpovědí okamžitě. Seznamte se s naší znalostní bází.
Polská firma
Jsme polská firma a veškeré daně odvádíme v Polsku. Volbou weSEQ.IT podporujete rozvoj polské vědy i ekonomiky. Seznamte se s našimi podmínkami spolupráce.
DŮVĚŘUJÍ NÁM
Co o nás říkají zákazníci?
Reference
Společnosti weSEQ.IT důvěřuje více než 40 vysokých škol, ústavů PAN a výzkumných pracovišť.
To je nejlepší důkaz kvality naší práce. Dlouhodobě spolupracujeme s vědeckými institucemi z celého Polska a komplexně zajišťujeme projekty sekvenování DNA a RNA - od přípravy vzorků až po bioinformatickou analýzu. Na vyžádání poskytujeme úplné reference a dokumenty požadované v zadávacích řízeních.
Vybrané realizované projekty a publikace našich zákazníků.
Podívejte se, pro které instituce provádíme sekvenování NGS a v jakých publikacích byla využita námi dodaná data.
se na nás obrátili s dalším projektem
v průměru na jeden subjekt
jsme obdrželi na základě doporučení
Platby
Financování přizpůsobené projektu.
Vyberte si způsob vyúčtování, který nejlépe odpovídá vašim potřebám. O zbytek se postaráme my.
Máte dotazy? Kontaktujte nás: contact@weseq.it
Poukazy
Strategické řízení rozpočtu z veřejných prostředků.
Blíží se termín vyúčtování projektu a klíčové analýzy NGS vyžadují čas?
Hodnotový poukaz nebo Poukaz na službu weSEQ.IT představuje účinný nástroj pro správu grantových prostředků.
Zajistěte si rozpočet již dnes a služby využijte během 12 měsíců v souladu s finančními postupy pro nakládání s veřejnými prostředky. Záruka kontinuity výzkumu bez časového tlaku.
Seznamte se s poukazy weSEQ.IT
Průběh spolupráce
Od poptávky k hotovým datům.
Odešlete poptávku -Požádejte o cenovou nabídku projektu
Systém krok za krokem ověří potřeby vašeho projektu.
Získejte cenovou nabídku
Do 48 hodin připravíme podrobnou cenovou nabídku.
Potvrďte nabídku
Potvrdíme podrobnosti a domluvíme vhodný termín vyzvednutí vzorků.
Vyzvednutí vzorků
Na odeslání vzorků máte až 8 měsíců. Kurýra si objednáte, až se vám to bude hodit.
Výsledky
Předáme vám data a bioinformatickou analýzu připravenou k publikaci.
Naše vize
„Naším cílem je umožnit vědcům každý den rozvíjet svůj potenciál a přispívat k pokroku vědy.“
FAQ
Časté dotazy.
Poskytujeme služby NGS a zároveň jsme vaším vědeckým partnerem, který vám pomůže naplánovat experiment, snížit riziko nákladných chyb a získat data nejlépe odpovídající cílům projektu. Naše podpora zahrnuje celý proces - od první konzultace přes sekvenování a bioinformatickou analýzu až po pomoc po předání výsledků.
Cena sekvenování závisí na specifikách projektu - mimo jiné na typu analýzy, počtu vzorků, zvolené technologii, požadované hloubce sekvenování a rozsahu bioinformatické analýzy. Proto nemáme univerzální ceník - pro každý projekt připravujeme individuální cenovou nabídku.
Abychom mohli připravit přesnou cenovou nabídku, vyplňte krátký formulář. Na jeho základě navrhneme optimální specifikaci projektu, vypracujeme bezplatnou cenovou nabídku a uvedeme předpokládanou dobu zpracování zakázky.
Doba zpracování zakázky (TAT) závisí na řadě proměnných, proto ji stanovujeme individuálně a závazně ji uvádíme v nabídce ještě před zahájením prací. Ovlivňuje ji mimo jiné rozsah zakázky (izolace, příprava knihoven, sekvenování, bioinformatická analýza - čím více fází, tím delší doba), typ analýzy (různé metody vyžadují různé přístroje, například sekvenování malých RNA obvykle trvá o několik dní déle než sekvenování mRNA), objem dat a způsob jejich předání i kvalita dodaných vzorků (pokud byť jediný neprojde QC, analýza čeká na vaše rozhodnutí ohledně tohoto vzorku).
Pokud vyúčtováváte grant s napjatým termínem, uveďte to v poptávce - navrhneme postup přizpůsobený vašemu harmonogramu. Více ve znalostní bázi: Doba zpracování zakázky (TAT).
Veškerá práva k datům a výsledkům zůstávají vám - nepoužíváme je k žádným jiným účelům.
Výsledky zpřístupňujeme prostřednictvím šifrovaného cloudu s infrastrukturou umístěnou na území Evropské unie, který splňuje požadavky GDPR. Data se přenášejí pomocí protokolu TLS/SSL, jsou šifrována algoritmem AES-256 a replikována mezi více datovými centry, což zajišťuje vysokou dostupnost a eliminuje jediný bod selhání.
Přístup k výsledkům je možný výhradně prostřednictvím zabezpečeného odkazu. Na požádání uzavíráme také dohodu o mlčenlivosti (NDA).
Kvalitu výsledků určuje výchozí materiál pro přípravu knihoven, proto je kvalita vzorků zásadní. Pokud se potýkáte s nízkou kvalitou vzorků, nabízíme službu izolace nukleových kyselin - automatizovaný postup, který poskytuje reprodukovatelné výsledky a omezuje lidské chyby.
Pokud nemůžete ověřit kvalitu materiálu před odesláním nebo často pracujete s problematickým materiálem, využijte Intervenční balíček QC - Backup: umožňuje odeslat až o 20 % více vzorků k analýze QC a na základě jejích výsledků se rozhodnete, které vzorky (v počtu uvedeném v objednávce) postoupí k přípravě knihoven - bez dalších nákladů na QC nadbytečných vzorků.
Více ve znalostní bázi: Izolace DNA nebo RNA a Intervenční balíček QC - Backup.
Ano, máte dvě možnosti - podle vašich potřeb.
1. Záložní vzorky (bezplatná možnost)
K zásilce přiložíte vzorky navíc. Použijeme je teprve tehdy, pokud vaše hlavní vzorky neprojdou kontrolou kvality (QC) - ušetříte čas a vyhnete se nákladům na přepravu další dávky materiálu.
2. Intervenční balíček QC - Backup (placená možnost)
Odešlete až o 20 % více vzorků, než je uvedeno v objednávce. Ověříme kvalitu (QC) všech zaslaných vzorků a vy se na základě hotových výsledků rozhodnete, které postoupí k sekvenování.
Úplné podmínky druhého řešení (včetně vyúčtování) jsme popsali ve znalostní bázi: Intervenční balíček QC - Backup. Doporučujeme si je před objednáním přečíst, abyste vybrali nejlepší možnost pro svůj projekt.
Ano, je nezbytnou součástí každé objednávky. U vzorků DNA/RNA kontrolujeme kvalitu celkem třikrát: po příjmu, po syntéze knihoven a po sekvenování.
Více ve znalostní bázi: Analýza kvality (QC).
Ano, ukázkové bioinformatické analýzy najdete v naší znalostní bázi: Bioinformatická analýza.
Jste připraveni zahájit projekt?
Náš systém vás provede krok za krokem.
Popište své potřeby a my odpovíme co nejdříve.
Dáváte přednost rozhovoru? Domluvte si online konzultaci.
První krok
Začneme?
Vyberte si, jak zahájíte spolupráci.