Přejít k obsahu

Vzorky vody

Zjistěte, jak odebrat, označit a zabezpečit vzorky vody, pokud izolaci nukleových kyselin provádí naše laboratoř.

KATEGORIE
Příprava zásilky a logistika vyzvednutí
FÁZE PROJEKTU
03 · Příprava a odeslání vzorků
DOBA ČTENÍ
2 min
AKTUALIZACE
6. listopadu 2024
ZPRACOVÁNÍ
Technický tým weSEQ.IT
Cenová nabídka

Příprava vzorků k odeslání je klíčovou fází každého výzkumu a poskytovaná služba může zahrnovat také izolaci nukleových kyselin z dodaného materiálu, například vody. Abyste vzorky správně připravili bez obav ze ztráty materiálu nebo jeho ochuzení, doporučujeme postupovat podle následujících pokynů:

Pokyny pro odběr vzorků vody

DŮLEŽITÉ

Použité vodní filtry by měly mít průměr 4 cm. Doporučujeme použít alespoň 3 filtry na vzorek (s viditelnými barevnými usazeninami na filtrech).

01Vyberte reprezentativní odběrové lokality a odběrová místa podle cílů výzkumu.
02Doporučujeme odebírat vzorky z více míst a vyvarovat se rozvíření sedimentů na dně. Zabraňte kontaminaci hrdla láhve prsty nebo jinými předměty.
03Do 4 hodin po odběru vzorků (vzorky uchovávejte ve tmě při teplotě 4 °C) proveďte vakuovou filtraci a zakoncentrujte mikroorganismy (paralelní vzorky / biologická opakování lze filtrovat přes stejný filtr). Alternativně vzorky vody přímo centrifugujte při teplotě 4 °C / 12 000 rpm po dobu 10 minut, odstraňte supernatant, zmrazte vzorky v kapalném dusíku a uchovávejte je při teplotě -80 °C až do přepravy na suchém ledu.
DŮLEŽITÉ

Před centrifugací posuďte, zda voda obsahuje velké množství organismů. Pokud je obsah biologického materiálu ve vodě nízký, centrifugujte alespoň 50 ml vody. Pokud je obsah biologického materiálu vysoký, centrifugujte odpovídající objem od 2 do 10 ml.

04Vysušené a rozmělněné nebo složené filtry s mikroorganismy (nebo sediment) uložte do sterilních zkumavek typu Eppendorf o objemu 2 ml nebo 5 ml a uchovávejte je při teplotě -20 °C nebo -80 °C až do přepravy na suchém ledu.

Doplňující informace

A. Pro filtrování velkých objemů vzorků vody s nízkým obsahem mikroorganismů používejte polyethersulfonové filtry s velikostí pórů 0,22 μm. Každý vzorek by měl obsahovat alespoň 1 litr vody.

B. Pro zakalené vzorky vody, které se filtrují pomalu nebo mají tendenci ucpávat filtry s velikostí pórů 0,22 μm, doporučujeme používat filtry ze směsi esterů celulózy s velikostí pórů 0,45 μm (acetát celulózy, nitrát celulózy). Tyto filtry nepoužívejte, pokud voda obsahuje insekticidy a herbicidy. Každý vzorek by měl obsahovat 0,5-1 litr vody a v případě ucpávání uchovávejte více filtrů ze stejného vzorku v jedné zkumavce.

C. Pokud vzorek vody obsahuje mnoho nerozpustných částic, použijte filtry s velikostí pórů 2-5 μm k odstranění nerozpustných nečistot a poté filtry s velikostí pórů 0,22 μm nebo 0,45 μm k zakoncentrování mikroorganismů. Každý vzorek by měl obsahovat 0,5-1 litr vody a v případě ucpávání filtrů uchovávejte více filtrů ze stejného vzorku v jedné zkumavce.

D. Pokud se výzkum zaměřuje na viry, nejprve z vody odfiltrujte bakterie a další velké buňky pomocí filtrů s velikostí pórů 0,22 μm a poté použijte kladně nabité filtry (například vložky Virozorb 1 MDS nebo NanoCeram Virus Sampler) k zakoncentrování virů. Každý vzorek by měl obsahovat 20 litrů vody.

KLÍČOVÁ SLOVA
eDNAFiltrace vodyFiltry 0,22 ummetagenomikaMikroorganismy ve voděOdběr vzorků vodyVzorky vodyMembránové filtryVzorky vody
Byl vám tento článek užitečný?
Vaše odpověď nám pomáhá zlepšovat znalostní bázi.

Hledáte jiný článek?

Zpět na všechna témata →

K vašemu dotazu zatím neexistuje článek?

Napište nám - odpovíme a doplníme jej do znalostní báze.

Dáváte přednost rozhovoru? Domluvte si online konzultaci.