Przygotowanie próbek do wysyłki jest kluczowym etapem każdego badania, a zakres wykonywanej usługi może obejmować również izolację kwasów nukleinowych z dostarczonego materiału m.in. wody. Aby poprawnie przygotować próbki, nie obawiając się o utratę materiału czy jego zubożenie zalecamy zastosowanie się do poniższej instrukcji:
INSTRUKCJA POBIERANIA PRÓBEK WODY
- Uwaga: Wykorzystane filtry do wody powinny mieć średnicę 4 cm. Rekomendujemy użycie co najmniej 3 filtrów na próbkę (z widocznymi osadami barwnymi na filtrach).
1. Wybierz reprezentatywne miejsca pobierania próbek oraz punkty poboru na podstawie celów badania.
2. Zalecamy pobieranie próbek z wielu punktów, unikając wzburzania osadów na dnie. Unikaj zanieczyszczenia otworu butelki palcami lub innymi przedmiotami.
3. W ciągu 4 godzin po pobraniu próbek (próbki powinny być przechowywane w ciemności w temperaturze 4°C), przefiltruj próżniowo i skoncentruj mikroorganizmy (równoległe próbki / powtórzenia biologiczne mogą być filtrowane przy użyciu tego samego filtra). Alternatywnie, odwirować próbki wody bezpośrednio w temperaturze 4°C / 12 000 rpm przez 10 minut, odrzucić supernatant, zamrozić próbki w ciekłym azocie i przechowywać je w temperaturze -80°C do czasu transportu na suchym lodzie.
- UWAGA: Przed wirowaniem obserwuj, czy w wodzie znajduje się dużo organizmów. Jeśli zawartość biologiczna w wodzie jest niska, odwiruj co najmniej 50 ml wody. Jeśli zawartość biologiczna jest wysoka, odwirować odpowiednią objętość od 2 do 10ml.
4. Przechowuj wysuszone i rozdrobnione lub złożone filtry z mikroorganizmami (lub osad) w sterylnych probówkach typu Eppendorf o pojemności 2 ml lub 5 ml, przechowuj je w temperaturze -20°C lub -80°C do transportu z użyciem suchego lodu.
Informacje dodatkowe:
A. Do filtrowania dużych objętości próbek wody o niskiej zawartości mikroorganizmów, używaj filtrów polieterosulfonowych o porowatości 0,22 μm. Każda próbka powinna obejmować co najmniej 1 litr wody.
B. Do mętnych próbek wody, które filtrują się wolno lub są podatne na zatykanie filtrów o porowatości 0,22 μm, zaleca się użycie filtrów z mieszanki estrów celulozy o porowatości 0,45 μm (octan celulozy, azotan celulozy). Unikaj używania takich filtrów, jeśli woda zawiera insektycydy i herbicydy. Każda próbka powinna mieć 0,5-1 litr wody, a w przypadku zatykania, przechowuj wiele filtrów z tej samej próbki w jednej probówce.
C. Jeśli w próbce wody znajduje się wiele nierozpuszczalnych cząstek, użyj filtrów o porowatości 2-5 μm, aby usunąć nierozpuszczalne zanieczyszczenia, a następnie użyj filtrów o porowatości 0,22 μm lub 0,45 μm do skoncentrowania mikroorganizmów. Każda próbka powinna mieć 0,5-1 litr wody, a w przypadku zatykania filtrów, przechowuj wiele filtrów z tej samej próbki w jednej probówce.
D. Jeśli badanie koncentruje się na wirusach, najpierw odfiltruj bakterie i inne duże komórki z wody przy użyciu filtrów o porowatości 0,22 μm, a następnie użyj filtrów o ładunku dodatnim (takich jak wkłady Virozorb 1 MDS lub NanoCeram Virus Sampler) do skoncentrowania wirusów. Każda próbka powinna mieć 20 litrów wody.