Wymagania dotyczące próbek - DNA/RNA

Przygotowanie próbki jest kluczowym etapem każdego badania, pozwalającym na dalsze zgłębianie nauk przyrodniczych i badanie różnic genetycznych w organizmie będącym przedmiotem zainteresowania. Dzięki próbkom kwasów nukleinowych o wyjątkowej jakości i w wystarczającej ilości Twoje projekty oparte o sekwencjonowanie mogą przebiegać sprawniej i mogą zapewnić bardziej wiarygodne dane do dalszej analizy bioinformatycznej. Wymagania dotyczące próbek wymienione poniżej to minimalne objętości i stężenia wymagane do analizy. Jeśli to tylko możliwe, zalecamy wysłanie większej ilości materiału.

METAGENOM

WYMAGANIA DLA PRÓBEK METAGENOMICZNYCH3 usługi

Usługa	Typ próbki	Ilośćng	Koncentracjang/uL
Amplicon	gDNA	≥500	≥20
Metagenomics	gDNA	≥500	≥20
Denovo (Nanopore)	Bacteria / Fungus	gDNA	≥2000 ≥40

TRANSKRYPTOM

WYMAGANIA DLA PRÓBEK TRANSKRYPTOMICZNYCH6 usług

Full-length transcriptome sequencing (TGS)

Usługa	Typ próbki	ObjętośćuL	Ilośćug	Koncentracjang/uL	RNA Integrity	Czystość (NanoDrop)
mRNA	Total RNA	≥10	≥2	≥50	≥7	OD260/280: 1.8-2.2 OD260/230: 0.5-2.5
mRNA	Total RNA	≥10	≥2	≥50	≥ 6 Plant
sRNA	Total RNA zawierające smallRNA	≥10	≥50	≥100	≥7.5
sRNA	Total RNA zawierające smallRNA	≥10	≥50	≥100	≥7 Plant
lncRNA	Total RNA	≥10	≥2	≥100	≥ 6.5
lncRNA	Total RNA	≥10	≥2	≥100	≥ 6 Plant
circRNA	Total RNA	≥10	≥2	≥100	≥ 6.5
circRNA	Total RNA	≥10	≥2	≥100	≥ 6 Plant
Nanopore	Total RNA	≥20	≥2	≥100	≥8	-
Nanopore	Total RNA	≥20	≥2	≥100	≥7.5 Plant
PacBio	Total RNA	≥20	≥2	≥150	≥9
PacBio	Total RNA	≥20	≥2	≥150	≥7.5 Plant

POZA TABELĄ · ULTRA-LOW INPUT RNA-SEQ

Typ próbkikomórki w roztworze lub małe ilości totalnego RNA

Rekomendowana ilość>1,000 komórek/próbki w Trizol lub 20 ng totalnego RNA

CAŁY GENOM (Whole Genome)

WYMAGANIA DLA PRÓBEK GENOMOWYCH8 usług

Usługa		Typ próbki	Ilośćug	Koncentracjang/uL	Nanopore/Qubit
Plant & Animal denovo/resequencing & Pan-Genome &Comarative genomics	PacBio CLR	gDNA	≥10	≥50	OD260/280: 1.7-2.2 OD260/230: 1.8-2.5
	PacBio CCS	gDNA	≥15	≥300	OD260/280: 1.7-2.2 OD260/230: 1.8-2.5
	Nanopore	gDNA	≥8	≥100	OD260/280: 1.7-2.2 OD260/230:≥1.5
	Nanopore (8K)	gDNA	≥2	≥100	OD260/280: 1.7-2.2 OD260/230:≥1.5
	NGS - Illumina	gDNA	≥1	≥30	OD260/280: 1.6-2.5 OD260/230:≥ 0.5
	NGS - BGI	gDNA	≥2	≥12.5	OD260/280: 1.6-2.5 OD260/230:≥ 0.5
Plant & Animal genome resequencing	PCR Product (band)	PCR	≥3	≥30
	PCR Product (band)	PCR	≥3	≥30	PCR Product (dispersion)	PCR	≥3	≥30

BIBLIOTEKI GOTOWE DO SEKWENCJONOWANIA

WYMAGANIA DLA GOTOWYCH BIBLIOTEK1 usługa

Usługa	Ilośćng	Koncentracjang/uL
Sequencing from premade libraries	≥500	≥20

WAŻNE

W wyjątkowych sytuacjach, jeśli materiał wymaga specjalnych wymagań/innych (np. niższe stężenie) niż podane powyżej, istnieje możliwość indywidualnego dostosowania ich do wymagań klienta po wcześniejszym uzgodnieniu z Opiekunem Klienta (contact@weseq.it).

Dodatkowo osobom, które nie są w stanie zweryfikować jakości swojego materiału przeznaczonego do analizy przed wysyłką, lub które mają często problem z uzyskaniem materiału wysokiej jakości polecamy Pakiet Interwencyjny QC.

W przypadku gdy usługa obejmuje izolację kwasów nukleinowych prosimy o zapoznanie się z wymaganiami dotyczącymi tkanek.

PLIKI DO POBRANIA

Sample Requirements weSEQ.ITPDF - 2,9 MBPOBIERZ

POWIĄZANE ARTYKUŁY

Zalecenia do przygotowania próbek do wysyłki Typy próbek Wymagania dotyczące próbek - TKANKI Próbki krwi pełnej Pellet z kultur bakteryjnych Próbki wody

SŁOWA KLUCZOWE

wymagania próbekilość DNAstężeniejakość DNARINprzygotowanie próbek

Czy ten artykuł był pomocny?

Twoja odpowiedź pomaga nam poprawiać bazę wiedzy.

← Poprzedni w etapie 03Typy próbek Następny w etapie 03 →Wymagania dotyczące próbek - TKANKI

Wymagania dotyczące próbek - DNA/RNA

METAGENOM

TRANSKRYPTOM

CAŁY GENOM (Whole Genome)

BIBLIOTEKI GOTOWE DO SEKWENCJONOWANIA

Szukasz innego artykułu?

Twoje pytanie nie ma jeszcze artykułu?