–Do składania genomu de novo ze świeżych liści wymagamy 2 g na badanie wstępne Illumina, co najmniej 5 g na PacBio i co najmniej 4 g na Hi-C.
–Do sekwencjonowania transkryptomu metodą NGS potrzebujemy 350 mg liści lub nasion, 500 mg mięśni zwierzęcych i 250 mg mózgu.
–Krew jest materiałem wyjątkowo wrażliwym ze względu na zdolność do koagulacji, dlatego prosimy o przygotowanie próbek według odrębnej procedury.
Przygotowanie próbki jest kluczowym etapem każdego badania, pozwalającym na dalsze zgłębianie nauk przyrodniczych i badanie różnic genetycznych w organizmie będącym przedmiotem zainteresowania. W ramach usługi możemy wykonać dla Państwa izolację kwasów nukleinowych z przesłanej tkanki. Dzięki próbkom o wyjątkowej jakości i w wystarczającej ilości Państwa projekty oparte o sekwencjonowanie mogą przebiegać sprawniej i mogą zapewnić bardziej wiarygodne dane do dalszej analizy bioinformatycznej. Wymagania dotyczące próbek w postaci tkanki wymienione poniżej to minimalne objętości wymagane do izolacji. Jeśli to tylko możliwe, zalecamy wysłanie większej ilości materiału.
SEKWENCJONOWANIE MIKROBIOMU
Mikroby
MIKROBY3 pozycje
Pochodzenie
ILLUMINA
PAC-BIO
ONT
Bakterie
1 x 107
≥ 3.5 x 1010
≥ 3.5 x 1010
Unicellular Grzyby
1 x 107
≥ 3.5 x 1010
≥ 3.5 x 1010
Makro Grzyby
≥ 4.0 g
≥ 10.0 g
≥ 10.0 g
WAŻNE
Do izolacji można wysłać pellet z kultury, jednak należy go odpowiednio przed wysyłką przygotować. Informacje jak poprawnie przygotować próbki z pelletem zostały opisane tutaj.
Skóra/ Wymaz z narządów płciowych/ Ślina/ Tkanka miękka jamy ustnej/ Wymaz z gardła/ Wymaz z odbytu
2-3 waciki
2-3 waciki
–
Odchody – zwierzęta
2 g
2 g
3 g
WAŻNE
Do izolacji można wysłać filtry po filtracji wody, jednak należy je odpowiednio przygotować. Informacje jak poprawnie przygotować próbki wody zostały opisane tutaj.
DE NOVO GENOME ASSEMBLY
DE NOVO GENOME ASSEMBLY8 pozycji
Pochodzenie
Tkanka
Badanie wstępne – Illumina
Pac-Bio
Hi-C
Zwierzęta
Trzewia
1 g
≥ 4 g
≥ 2.0 g
Mięśnie
1 g
≥ 5 g
≥ 2.0 g
Krew ssaków*
1 g
≥ 5 ml
≥ 2 mL
Krew ryb/drobiu*
1 g
≥ 1 ml
≥ 2 mL
Rośliny
Świeże liście
2 g
≥ 5 g
≥ 4.0 g
Płatki / łodygi
2 g
≥ 10 g
–
Korzenie / nasiona
2 g
≥ 20 g
–
Komórki
Kultura komórka
–
≥ 1 x 108
≥ 1 x 107
GENETYKA POPULACYJNA
GENETYKA POPULACYJNA8 pozycji
Pochodzenie
Tkanka
WGS – Illumina
WGS -ONT
SLAF-seq
Zwierzęta
Trzewia
1 g
≥ 4 g
≥ 0.5 g
Mięśnie
1 g
≥ 5 g
≥ 0.5 g
Krew ssaków*
1.5 ml
≥ 5 ml
1.5 ml
Krew ryb/drobiu*
1.5 ml
≥ 1 ml
1.5 ml
Rośliny
Świeże liście
2 g
≥ 5 g
1 g
Płatki / łodygi
2 g
≥ 10 g
1 g
Korzenie / nasiona
2 g
≥ 20 g
1 g
Komórki
Kultura komórek
–
≥ 1 x 108
–
SEKWENCJONOWANIE TRANSKRYPTOMU
SEKWENCJONOWANIE TRANSKRYPTOMU13 pozycji
Pochodzenie
TKANKA
NGS
TGS
Lnc-RNA
small-RNA
Zwierzęta
Serce / jelito
350 mg
350 mg
500 mg
500 mg
Wnętrzności / mózg
250 mg
250 mg
250 mg
250 mg
Mięśnie
500 mg
500 mg
600 mg
600 mg
Kości / włosy / skóra
1 g
1 g
1.5 g
1.5 g
Rośliny
Korzenie / płatki / łodygi
500 mg
600 mg
600 mg
600 mg
Liście / nasiona
350 mg
350 mg
350 mg
350 mg
Owoce
1.5 g
1.5 g
1.5 g
1.5 g
Komórki
Kultura komórek
3 x 106
3 x 106
3 x 106
3 x 106
Stawonogi
Owady
6
6
9
9
Skorupiaki
350 mg
350 mg
500 mg
500 mg
Pełna krew*
Krew*
1 probówka
1 probówka
2 probówki
2 probówki
Surowica
–
–
6 ml
6 ml
Osocze
–
–
6 ml
6 ml
W wyjątkowych sytuacjach, jeśli materiał w projekcie wymaga specjalnych wymagań/innych (np. mniejsza ilość) niż podane powyżej, istnieje możliwość indywidualnego dostosowania ich do wymagań klienta po wcześniejszym uzgodnieniu z Zespołem Wsparcia.
* Krew stanowi wyjątkowo wrażliwy materiał ze względu na zdolność do koagulacji. Celem zabezpieczenia Państwa materiału na czas transportu prosimy o przygotowanie próbek krwi zgodnie z procedurą dot. przygotowania krwi.
Polish 
English