Genomický výzkum umožňuje poznat strukturu, organizaci a variabilitu genetického materiálu. V závislosti na cíli projektu může analýza zahrnovat celý genom, kódující oblasti nebo vybrané úseky DNA. Nabízíme řešení pro analýzu genomů člověka, rostlin, živočichů a mikroorganismů. Realizujeme projekty zahrnující resekvenování vůči referenčnímu genomu, identifikaci genetických variant, genotypizaci a sestavování genomů de novo.
Pomůžeme vám zvolit vhodnou metodu sekvenování, požadované množství dat a rozsah bioinformatické analýzy podle typu organismu, kvality biologického materiálu, počtu vzorků a výzkumného záměru. Vyberte službu, která vás zajímá, a seznamte se s dostupnými variantami, požadavky na materiál a možným rozsahem realizace projektu.
- Celogenomové sekvenování - Celogenomové sekvenování umožňuje analyzovat veškerý genetický materiál organismu. V závislosti na cíli projektu jej lze využít k resekvenování vůči referenčnímu genomu, identifikaci variant nebo sestavení genomu de novo.
- Celogenomové sekvenování člověka - Celogenomové sekvenování člověka pro výzkumné projekty. Umožňuje komplexní identifikaci genetické variability i mimo kódující oblasti. Rozsah analýzy může zahrnovat mimo jiné identifikaci SNP, indel, CNV a strukturních variant.
- WGS rostlin & živočichů - Sekvenování genomů rostlin a živočichů v projektech resekvenování, populační genomiky a sestavování genomů de novo. Přístup volíme podle velikosti a složitosti genomu, míry heterozygotnosti, podílu repetitivních sekvencí a očekávané kvality sestavení.
- WGS mikroorganismů - Sekvenování celých genomů bakterií, hub a dalších mikroorganismů. Služba může zahrnovat identifikaci organismu, resekvenování, sestavování genomu de novo, genomovou anotaci a analýzu rozdílů mezi kmeny nebo izoláty.
- Celoexomové sekvenování - Celoexomové sekvenování se zaměřuje na oblasti genomu kódující proteiny. WES představuje efektivní řešení pro projekty, jejichž hlavním cílem je identifikace variant v exonech bez nutnosti celogenomového sekvenování.
- Genotypizace & sekvenování redukované reprezentace genomu - Metody genotypizace a sekvenování redukované reprezentace genomu umožňují analyzovat genetickou variabilitu ve velkých souborech vzorků při omezeném množství generovaných dat. Tato řešení nacházejí uplatnění mimo jiné v populační genomice, analýze genetické diverzity, mapování znaků a asociačních studiích. SLAF-seq, tedy Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing, je metoda sekvenování vybraných úseků genomu, která umožňuje identifikaci a genotypizaci velkého počtu markerů. Metoda je zvláště vhodná pro projekty zahrnující velký počet jedinců, mimo jiné pro populační analýzy, genetické mapování, studie GWAS a selekci pomocí markerů.
Kterou službu zvolit?
Potřebujete informace o celém genomu?
Zvolte celogenomové sekvenování. Poté přejděte na řešení určené pro člověka, rostliny a živočichy nebo mikroorganismy.
Zajímají vás především kódující oblasti?
Zvažte celoexomové sekvenování, které se zaměřuje na exony a varianty v nich obsažené.
Analyzujete velký počet jedinců?
Metody genotypizace & sekvenování redukované reprezentace genomu - SLAF-seq, umožňují omezit rozsah sekvenované části genomu a optimalizovat náklady na populační projekty.
Naplánujte si projekt
Volba vhodné metody závisí na zkoumaném regulačním mechanismu, druhu materiálu, velikosti genomu a požadovaném rozlišení analýzy. Sdělte nám informace o organismu, typu vzorků, počtu experimentálních skupin a cíli studie a my vám pomůžeme zvolit vhodnou technologii a rozsah analýzy dat.
VYPLŇTE SPECIFIKACI PROJEKTU → zde
Nejste si jisti, která metoda bude nejvhodnější? Vyplňte dostupné informace a uveďte, že potřebujete pomoc s plánováním experimentu.
DOMLUVTE SI KONZULTACI → zde