GENOMICS

W SKRÓCIE
Usługi genomiczne dzielimy na trzy grupy: WGS, WES oraz genotypowanie i sekwencjonowanie zredukowanej reprezentacji genomu.
Sekwencjonujemy genomy roślin, zwierząt i mikroorganizmów, a genom człowieka na potrzeby projektów badawczych.
WGS odczytuje cały materiał genetyczny i służy między innymi do resekwencjonowania, identyfikacji wariantów oraz składania genomu de novo, a WES ogranicza analizę do regionów kodujących białka.
Metody zredukowanej reprezentacji, w tym SLAF-seq, wybiera się przy dużej liczbie osobników: ograniczają ilość danych i koszt analiz populacyjnych, mapowania genetycznego, badań GWAS i selekcji markerowej.

Badania genomowe pozwalają poznać strukturę, organizację oraz zmienność materiału genetycznego. W zależności od celu projektu analiza może obejmować cały genom, regiony kodujące lub wybrane fragmenty DNA. Oferujemy rozwiązania przeznaczone do analizy genomów człowieka, roślin, zwierząt i mikroorganizmów. Realizujemy projekty obejmujące resekwencjonowanie względem genomu referencyjnego, identyfikację wariantów genetycznych, genotypowanie oraz składanie genomów de novo.

Pomagamy dobrać odpowiednią metodę sekwencjonowania, wymaganą ilość danych i zakres analizy bioinformatycznej do rodzaju organizmu, jakości materiału biologicznego, liczby próbek oraz założeń badawczych. Wybierz interesującą Cię usługę, aby poznać dostępne warianty, wymagania dotyczące materiału oraz możliwy zakres realizacji projektu.

  • Whole Genome Sequencing – Sekwencjonowanie całogenomowe umożliwia analizę kompletnego materiału genetycznego organizmu. W zależności od celu projektu może zostać wykorzystane do resekwencjonowania względem genomu referencyjnego, identyfikacji wariantów lub złożenia genomu de novo.
    • Human WGS – Sekwencjonowanie całego genomu człowieka na potrzeby projektów badawczych. Umożliwia kompleksową identyfikację zmienności genetycznej, również poza regionami kodującymi. Zakres analizy może obejmować między innymi identyfikację SNP, InDel, CNV oraz wariantów strukturalnych.
    • Plant & Animal WGS – Sekwencjonowanie genomów roślin i zwierząt w projektach resekwencjonowania, genomiki populacyjnej oraz składania genomów de novo. Dobieramy podejście do wielkości i złożoności genomu, poziomu heterozygotyczności, zawartości sekwencji powtarzalnych oraz oczekiwanej jakości złożenia.
    • Microbe WGS – Sekwencjonowanie całych genomów bakterii, grzybów i innych mikroorganizmów. Usługa może obejmować identyfikację organizmu, resekwencjonowanie, składanie genomu de novo, adnotację genomową oraz analizę różnic pomiędzy szczepami lub izolatami.
  • Whole Exome SequencingWhole Exome Sequencing koncentruje analizę na regionach genomu kodujących białka. WES stanowi efektywne rozwiązanie dla projektów, których głównym celem jest identyfikacja wariantów w eksonach, bez konieczności sekwencjonowania całego genomu.
  • Genotyping & Reduced Representation Sequencing – Metody genotypowania i sekwencjonowania zredukowanej reprezentacji genomu umożliwiają analizę zmienności genetycznej w dużych grupach próbek przy ograniczeniu ilości generowanych danych. Rozwiązania te znajdują zastosowanie między innymi w genomice populacyjnej, analizie różnorodności genetycznej, mapowaniu cech oraz badaniach asocjacyjnych. SLAF-seq, czyli Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing, jest metodą sekwencjonowania wybranych fragmentów genomu, umożliwiającą identyfikację i genotypowanie dużej liczby markerów. Metoda jest szczególnie przydatna w projektach obejmujących liczne osobniki, między innymi w analizach populacyjnych, mapowaniu genetycznym, badaniach GWAS oraz selekcji wspomaganej markerami.

KTÓRĄ USŁUGĘ WYBRAĆ?

Potrzebujesz informacji o całym genomie?

Wybierz Whole Genome Sequencing. Następnie przejdź do rozwiązania przeznaczonego dla człowieka, roślin i zwierząt albo mikroorganizmów.

Interesują Cię przede wszystkim regiony kodujące?

Rozważ Whole Exome Sequencing, które koncentruje analizę na eksonach i znajdujących się w nich wariantach.

Analizujesz dużą liczbę osobników?

Metody Genotyping & Reduced Representation Sequencing – SLAF-seq, pozwalają ograniczyć zakres sekwencjonowanego genomu i zoptymalizować koszt projektów populacyjnych.

ZAPLANUJ PROJEKT

Dobór odpowiedniej metody zależy od badanego mechanizmu regulacyjnego, rodzaju materiału, wielkości genomu oraz oczekiwanej rozdzielczości analizy. Przekaż nam informacje o organizmie, rodzaju próbek, liczbie grup eksperymentalnych i celu badania, a pomożemy dobrać odpowiednią technologię oraz zakres analizy danych.

WYPEŁNIJ SPECYFIKACJĘ PROJEKTU → tutaj

Nie masz pewności, która metoda będzie najlepsza? Uzupełnij dostępne informacje i zaznacz, że potrzebujesz pomocy w zaplanowaniu eksperymentu.

UMÓW KONSULTACJĘ → tutaj

Czy ten artykuł był pomocny?
Twoja odpowiedź pomaga nam poprawiać bazę wiedzy.
Was this article helpful?

Related Articles

pl_PLPolish